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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001017`

染色体: Chr02 坐标: 17939512-17940285 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001017`
名称	SmilChr02G001017
描述	uncharacterized SmilChr02G001017
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	17939512 - 17940285 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008083`
GeneID	`131008083`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008083`
原始查询	`SmilChr02G001017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=32.2; qcov=0.556; evalue=2.78e-22; confidence=low
Rice	`Os09g0268800` - identity=28; qcov=0.486; evalue=1.1e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008083

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057790965.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790965.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057790965.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790965.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790965.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:17939517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B15
`Chr2:17939518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C35
`Chr2:17939540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:17939542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,C8,C87
`Chr2:17939545`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	118	A1,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A21,A23,A24,A25,A4,A7,A9,B104,B106,B107,B11,B111,B112,B113,B12,B123,B127,B128,B129,B13,B130,B134,B136,B140,B15,B16,B18,B20,B23,B27,B28,B3,B30,B32,B36,B37,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B48,B49,B5,B50,B55,B57,B59,B61,B62,B67,B69,B7,B71,B72,B77,B82,B84,B85,B93,B94,B98,B99,C11,C14,C16,C17,C18,C25,C27,C29,C3,C31,C33,C34,C42,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C53,C54,C56,C58,C59,C62,C64,C66,C67,C69,C7,C73,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C85,C9,D1,D2,D3,D6,D7,D8,D9
`Chr2:17939595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B111,C13,C56
`Chr2:17939679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:17939687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:17939737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:17939826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B12,B55
`Chr2:17939826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr2:17939844`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A20,B2,B21,B87,C34,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790965.1

257 aa

128

257

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 105-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790965.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	105	149	2.2e-07	31.1	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934982.1
ATGGGAAAGGGTTACTATACTCTCAGATTTCAGTTTCAAGAGGATAAAGCCACTGCCAAAGCTAATCTTTTATGGGATTTATCTGTCGGATCGCTTTGGTTACGTGATTGGGTACGTTACTTTAATCCCTACAAGGAACCTTCTTCTCTCGCTCAGGTGTGGGTTCGGATTTATTATTTGCCTGTGGAGTTTTGGCATCCTGAAGTTATTTCGGGTATTGGAAGTTGGCTTGGACAACCGTTGAAAATTGATGGAAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008083
ATGGGAAAGGGTTACTATACTCTCAGATTTCAGTTTCAAGAGGATAAAGCCACTGCCAAAGCTAATCTTTTATGGGATTTATCTGTCGGATCGCTTTGGTTACGTGATTGGGTACGTTACTTTAATCCCTACAAGGAACCTTCTTCTCTCGCTCAGGTGTGGGTTCGGATTTATTATTTGCCTGTGGAGTTTTGGCATCCTGAAGTTATTTCGGGTATTGGAAGTTGGCTTGGACAACCGTTGAAAATTGATGGAAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790965.1
MGKGYYTLRFQFQEDKATAKANLLWDLSVGSLWLRDWVRYFNPYKEPSSLAQVWVRIYYLPVEFWHPEVISGIGSWLGQPLKIDGNSMTEDVGHFVRMLVEIDLAQPLPVTLNIDGGDYAFPVEFSYEYLPIFCHRCKITGHSMEKCRKGDKSQGKTTDEVEKGDKGPEGHAVGKAVVQASVLHANTEALEVVDKVVEVRSALTERAQVEQTMGEQQSGSSGNYFSPLVTAEQSSEMADHRLYGPDYGCVEADYSTG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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