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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001021`

染色体: Chr02 坐标: 18031757-18037381 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001021`
名称	SmilChr02G001021
描述	cellulose synthase-like protein E1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	18031757 - 18037381 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011442`
GeneID	`131011442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011442`
原始查询	`SmilChr02G001021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cellulose synthase-like protein E1
产物	cellulose synthase-like protein E1
Arabidopsis	`AT1G55850` (CSLE1) cellulose synthase like E1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842035] identity=56; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0478100` (OsCslE1) - identity=53; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009833 (plant-type primary cell wall biogenesis); GO:0016760 (cellulose synthase (UDP-forming) activity); GO:0030244 (cellulose biosynthetic process); GO:0051753 (mannan synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03552 (Cellulose_synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057795222.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057795222.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057795222.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795222.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795222.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:18031962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B6
`Chr2:18031962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr2:18031979`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C1,C78
`Chr2:18031979`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C1,C78
`Chr2:18032189`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:18032189`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:18032191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:18032299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr2:18032703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B1,B140,B69
`Chr2:18032923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B93
`Chr2:18033217`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B127,B27,B44
`Chr2:18033217`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B127,B27,B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795222.1

725 aa

362

725

Cellulose_synt

PF03552 Cellulose_synt 93-384 aa PF03552 Cellulose_synt 402-722 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795222.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	93	384	6.2e-139	465.4	Cellulose synthase
`XP_057795222.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	402	722	6.2e-139	465.4	Cellulose synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939239.1
TCATAAACGGAACGAGTATTTCTTACGGGGAGAACACGAATATTATTAGGCGGCGAGGGATGCATTGCATGTTATTTTACCTTTTCCATACCGAAAAGAGAAATAAGCAAAAACTCAAATTTCGGTCCAACTCTGTCTATTATTGAATGGAATATCATCTCCTGCATCACCCAGCAAAATACTTTCTCCAAGGCTGCGATATGGGGCCACTTCAAAAGTTAAAATCCAAAACGCCCACCATGTGTTGTATATATATAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011442
ATGGCTGAAAACTCACTTTTCGAAACCAAGAAAGTCAAGGGCGGTTCCGTCTACAAGCTCTTTGCTACTTCCATATTCGTGGGAATCATTCTGATTTGGGTTTACAGAGCAACTCACGTCATCGAAAATGGGAGGCTTGTTTGGATGGGAATGCTTGCAGCAGAATTATGGTTCGGGTTTTACTGGATCCTCACTCAGTCCCATCGCTGGAATCGCGTTCATCGCCGCACCTTCAAAGACAGGCTCTCGCAGAGGTACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795222.1
MAENSLFETKKVKGGSVYKLFATSIFVGIILIWVYRATHVIENGRLVWMGMLAAELWFGFYWILTQSHRWNRVHRRTFKDRLSQRYENDLGGVDIFVCTADPKIEPPMLVINTVLSVMAYDYPPEKLAVYLSDDAASDLTFYALLEASTFAKHWLPYCKKFKVEPRSPQPYFSSESAHLEPHQAQRFASLKKLYEEMENRIELAKKLGTVAKSALIDHRGFSSWDSYRSQTDHDAMLHILIDRDGEATDIEGCRLPTLVY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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