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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001024`

染色体: Chr02 坐标: 18153211-18157450 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001024`
名称	SmilChr02G001024
描述	uncharacterized SmilChr02G001024
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	18153211 - 18157450 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011445`
GeneID	`131011445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011445`
原始查询	`SmilChr02G001024`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA polymerase III RPC4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830797]; symbol=AT5G09380; hit=AT5G09380; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RNA polymerase III RPC4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830797]; symbol=AT5G09380; hit=AT5G09380; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G09380` (AT5G09380) RNA polymerase III RPC4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830797] identity=33.6; qcov=0.912; evalue=1.17e-38; confidence=low
Rice	`Os04g0394500` (OsRPC53) - identity=30.6; qcov=0.927; evalue=3.35e-33; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0006383 (transcription by RNA polymerase III)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05132 (RNA_pol_Rpc4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795224.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795224.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795224.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795224.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795224.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:18155326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:18156224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C43
`Chr2:18156283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:18156303`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr2:18156303`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr2:18157085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795224.1

367 aa

184

367

RNA_pol_Rpc4

PF05132 RNA_pol_Rpc4 209-358 aa

XP_057795225.1

367 aa

184

367

RNA_pol_Rpc4

PF05132 RNA_pol_Rpc4 209-358 aa

XP_057795226.1

342 aa

171

342

RNA_pol_Rpc4

PF05132 RNA_pol_Rpc4 209-318 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795224.1`	Pfam	`PF05132`	RNA_pol_Rpc4	Family	209	358	2.1e-26	93.6	RNA polymerase III RPC4
`XP_057795225.1`	Pfam	`PF05132`	RNA_pol_Rpc4	Family	209	358	2.1e-26	93.6	RNA polymerase III RPC4
`XP_057795226.1`	Pfam	`PF05132`	RNA_pol_Rpc4	Family	209	318	2.3e-10	41.6	RNA polymerase III RPC4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939241.1
AGTTACTATGCGAACTCATTTTATAAAGATCTAAGTGATGGTAGTACAGATTTTTATGAAAACCGGTAGTACAGTTAAAAATATACTCCAATGTTGGTTTAATAATAGTCTCTCTTCCATCTTACCTCTAGTCTTCAATTCTGATTTCTGAGATTAACTTCCTAATACTCTCCCGTCTTCCCTCTACCTCACCTCATATGCTTCTCTCTCTACTCTCCGTCAGAGATCTGTGCCGCCGCCGCTGCACCACCCGACGACCA...

XM_057939243.1
TGGTAGTACAGATTTTTATGAAAACCGGTAGTACAGTTAAAAATATACTCCAATGTTGGTTTAATAATAGTCTCTCTTCCATCTTACCTCTAGTCTTCAATTCTGATTTCTGAGATTAACTTCCTAATACTCTCCCGTCTTCCCTCTACCTCACCTCATATGCTTCTCTCTCTACTCTCCGTCAGAGATCTGTGCCGCCGCCGCTGCACCACCCGACGACCACCTTCTTCCCTTCGTCGTTTTCATCAAATTCCAAACCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131011445
ATGGATCCAGACCCACCTTCGCCCTCTCCAAGAAAGGTTAAGTTTCGTCCAAAAGCACCACCCCCTCGAAGAACCCGGCGACACACTACCACTGAAATTGAGGAGGATAGTGGCGATGATAGCGAAGCGCAACAATTCCTTTCACGCAGACTTTCCGAGCATCTAGCAAGGCGGGGAGCAAAAGTGGAGAAGAAATCTCCAGCGCAAGTTGCCTTTTCACATGGAGTTGCATCTAGTACCATAAGGAGCTTTGGCAGACA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057795224.1
MDPDPPSPSPRKVKFRPKAPPPRRTRRHTTTEIEEDSGDDSEAQQFLSRRLSEHLARRGAKVEKKSPAQVAFSHGVASSTIRSFGRQRQRTDDGSERTNDGSSAAYSEASTTGEMQDHFTSIPTAETQGVADNTVDLTDAAIVKKKKEYREPWDYHHSYYPITLPLRRPHSGNPEVLDKAEFEGALEYDENTLKSAEVLGLLDQDDTPKMLLFVFPSNLPVGRRPTNASRRETDDNMKAVENSRKNGKGNEKVMVGSVAK...

XP_057795225.1
MDPDPPSPSPRKVKFRPKAPPPRRTRRHTTTEIEEDSGDDSEAQQFLSRRLSEHLARRGAKVEKKSPAQVAFSHGVASSTIRSFGRQRQRTDDGSERTNDGSSAAYSEASTTGEMQDHFTSIPTAETQGVADNTVDLTDAAIVKKKKEYREPWDYHHSYYPITLPLRRPHSGNPEVLDKAEFEGALEYDENTLKSAEVLGLLDQDDTPKMLLFVFPSNLPVGRRPTNASRRETDDNMKAVENSRKNGKGNEKVMVGSVAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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