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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001029`

染色体: Chr02 坐标: 18211138-18211711 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001029`
名称	SmilChr02G001029
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	18211138 - 18211711 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008089`
GeneID	`131008089`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008089`
原始查询	`SmilChr02G001029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00810` - identity=42.4; qcov=0.697; evalue=4.27e-20; confidence=low
Rice	`Os11g0656500` - identity=40.6; qcov=0.676; evalue=1.16e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790972.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057790972.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790972.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790972.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:18211153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:18211214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:18211226`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B113
`Chr2:18211226`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B113
`Chr2:18211240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:18211426`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A24
`Chr2:18211430`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A24
`Chr2:18211430`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A24
`Chr2:18211432`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A24
`Chr2:18211432`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A24
`Chr2:18211434`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A24
`Chr2:18211434`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790972.1

142 aa

142

RVT_2

PF07727 RVT_2 1-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790972.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	1	56	8.4e-11	42.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934989.1
ATGAACAATAAGTTTGCTCTCACTTATCTGGGTTCAATTCACTACTTTTTGGGAATAGAGGTTACCAAATCCGGCTCCAACTATGCTTTGTGTCAATCTAAATATCTCAAAGAACTACTGGAGAAAACCAACATGAGTTCTTGTCATCCTTGCTCAACTCCAATGACACCTGCCACTCGACTTTCCAAGGAAGGTGGTGAGTCGTTTTCTGATCCTTCACTATACAGAAGCACCATTGGTGCCCTACAATATCTTACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008089
ATGAACAATAAGTTTGCTCTCACTTATCTGGGTTCAATTCACTACTTTTTGGGAATAGAGGTTACCAAATCCGGCTCCAACTATGCTTTGTGTCAATCTAAATATCTCAAAGAACTACTGGAGAAAACCAACATGAGTTCTTGTCATCCTTGCTCAACTCCAATGACACCTGCCACTCGACTTTCCAAGGAAGGTGGTGAGTCGTTTTCTGATCCTTCACTATACAGAAGCACCATTGGTGCCCTACAATATCTTACACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790972.1
MNNKFALTYLGSIHYFLGIEVTKSGSNYALCQSKYLKELLEKTNMSSCHPCSTPMTPATRLSKEGGESFSDPSLYRSTIGALQYLTHTRPDIAFAMPIMPAVLMIGAPLEGTVSIMETISLPGAPKSNTWYPEAARNLNIVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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