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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001042`

染色体: Chr02 坐标: 18495977-18498415 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001042`
名称	SmilChr02G001042
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2-23 kDa-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	18495977 - 18498415 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011456`
GeneID	`131011456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011456`
原始查询	`SmilChr02G001042`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2-23 kDa-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2-23 kDa-like
Arabidopsis	`AT1G63800` (UBC5) ubiquitin-conjugating enzyme 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842683] identity=79.4; qcov=1.03; evalue=4.69e-106; confidence=high
Rice	`Os10g0447100` (OsUBC10) - identity=90; qcov=0.761; evalue=1.38e-94; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795238.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795238.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795238.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795238.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795238.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:18496439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B130,D10
`Chr2:18496440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:18496986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B66,C10,C17
`Chr2:18497142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B96,C36
`Chr2:18497177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr2:18497351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:18497360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C16,C45,C49,C57
`Chr2:18498129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:18498156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B54,B57,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795238.1

184 aa

184

UQ_con

PF00179 UQ_con 9-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795238.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	9	142	2.2e-39	134.9	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939255.1
ATATTGCATATAGAGAGAGAAGGTGACTGTGGAATTGCCCATGTGTGCATATACATGTATTATTACAAATGCATATATGAATTAATTCATTCATCTTCTCAACCTTGCTTCTTTAACTTGAACAAGTAACTTCATTCTTCACCTCTTTCTCTCTCATCCCTCCTTTCCCTTCTCCAAAGAGAGAGAAGCAAGCTCAGAAATTACAACTAAATTCAAGAATTTCAACATGTCTTCCCCAAGCAAGAGGCGCGAGATGGACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011456
ATGTCTTCCCCAAGCAAGAGGCGCGAGATGGACTTGATGAAATTGTTGATGAGTGATTACAAGGTGGAGATGATCAATGATGGGATGCAGGAGTTTTATGTGCATTTTCACGGCCCCAGTGAGAGTCCTTACCACGGCGGTGTATGGAAAATACGGGTGGGGCTTCCTGATGCATACCCGTACAAGTCTCCTTCGATAGGATTTATTAACAAGATGTACCATCCCAATGTGGATGAGATGTCGGGTTCCGTGTGTTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795238.1
MSSPSKRREMDLMKLLMSDYKVEMINDGMQEFYVHFHGPSESPYHGGVWKIRVGLPDAYPYKSPSIGFINKMYHPNVDEMSGSVCLDVINQTWSPMFDLVNVFEVFLPQLLLYPNPSDPLNGEAAALMLRDRPAYEQRVKEYCQKYAKPEDVGAVPEEEESSDEELSEDESDSSDDEVAGPVDP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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