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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001049`

染色体: Chr02 坐标: 18566423-18567151 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001049`
名称	SmilChr02G001049
描述	uncharacterized SmilChr02G001049
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	18566423 - 18567151 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008092`
GeneID	`131008092`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008092`
原始查询	`SmilChr02G001049`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=36.1; qcov=0.698; evalue=5.44e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008092

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790975.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790975.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790975.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790975.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:18566425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C6
`Chr2:18566427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C42
`Chr2:18566438`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A1,A13,A19,A21,A8,B100,B111,B121,B123,B131,B133,B139,B14,B18,B31,B35,B47,B54,B55,B56,B59,B6,B68,B73,B85,B96,C18,C22,C23,C37,C49,C50,C51,C54,C60,C61,C65,C67,C69,C7,C78,C81,C83,C84,C87,D4,D5,D8
`Chr2:18566450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A1,A18,A2,A23,A24,A25,B111,B117,B118,B121,B122,B129,B131,B136,B139,B140,B19,B24,B49,B65,B68,B7,B84,B93,C1,C11,C12,C2,C23,C28,C29,C30,C42,C49,C51,C57,C58,C61,C63,C7,C79,C80,C82,C86,D3,D4,D5,D6
`Chr2:18566480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	98	A10,A11,A15,A2,A22,A24,A3,A5,A6,A9,B1,B100,B105,B106,B107,B111,B113,B114,B131,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B15,B20,B23,B24,B27,B28,B31,B35,B38,B44,B46,B5,B55,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B66,B68,B70,B71,B74,B76,B79,B91,B93,B94,B95,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C18,C2,C20,C21,C28,C30,C39,C40,C43,C45,C50,C51,C53,C55,C58,C6,C65,C7,C73,C74,C75,C78,C8,C80,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D2,D3,D5,D9
`Chr2:18566490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:18566549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A8,B26
`Chr2:18566549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B26
`Chr2:18566552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B106,B125,B2,B39,B48,B60,B65,B71,B8,C39,C58,C62,C76,D10
`Chr2:18566559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,C55,C57,C73,C8
`Chr2:18566573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B92,C27
`Chr2:18566574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790975.1

242 aa

121

242

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 43-205 aa PF03732 PEG10_N-capsid 45-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790975.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	43	205	1e-10	42.1	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057790975.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	45	123	4.8e-09	37.1	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934992.1
ATGCCTCCGAGAAGACAAAATCAAAACCGAGTAGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAACAAAGAGATCCCACACCACCACCTCCACCTCCTCCACAGCAAGAGAGGAGAGTAGAAGAGCTCTTTCTACGACAAAACCCACCTACTTTCAGCGGAGCTGGAGACCCCGCTGAAACGGAAGAATGGATCAGAAGTATGGAAAGAATTTTTAGATTCCTTAGATGTAACGATGTCGAGCGCCTCATGTGCATGTCTTACCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008092
ATGCCTCCGAGAAGACAAAATCAAAACCGAGTAGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAACAAAGAGATCCCACACCACCACCTCCACCTCCTCCACAGCAAGAGAGGAGAGTAGAAGAGCTCTTTCTACGACAAAACCCACCTACTTTCAGCGGAGCTGGAGACCCCGCTGAAACGGAAGAATGGATCAGAAGTATGGAAAGAATTTTTAGATTCCTTAGATGTAACGATGTCGAGCGCCTCATGTGCATGTCTTACCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790975.1
MPPRRQNQNRVEEEEEEEEQRDPTPPPPPPPQQERRVEELFLRQNPPTFSGAGDPAETEEWIRSMERIFRFLRCNDVERLMCMSYQLKGSAEYSWEAKQKTLTPDQVNELTWEKFKAALCEKYIPRSYRKKKEMEFVSLKQGNKTVAEYDRLFCDLARYAPYRVDTDEKMSELFCAGLKQEIRVVLASQSALTYAEALNRALDMELAMQPEKTSQLSVLQVNPNAQSGSQSFYGQGQKGKRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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