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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001062`

染色体: Chr02 坐标: 18924230-18925980 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001062`
名称	SmilChr02G001062
描述	pectinesterase QRT1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	18924230 - 18925980 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011468`
GeneID	`131011468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011468`
原始查询	`SmilChr02G001062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase QRT1-like
产物	pectinesterase QRT1-like
Arabidopsis	`AT5G19730` (AT5G19730) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832093] identity=48.6; qcov=1; evalue=2.09e-48; confidence=medium
Rice	`Os01g0743200` (OsPME5) - identity=50; qcov=1; evalue=3.19e-51; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057795246.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057795246.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795246.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795246.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:18924668`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr2:18924668`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr2:18924718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr2:18924885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795246.1

144 aa

144

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 2-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795246.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	2	137	1.4e-27	96.9	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939263.1
ATTAAGCTAAGCCTCGTAACATCACTCTTCCTTCAATTCTTTTACAAGTGAATGACTTCCTCATAAATCCTGTAGCTCTAGCTAGCTTCCAATTAATAAATCAACGTTTCATCCTACGCAGCAACTGCTTCTTCTGCATTTCTCATGCGTTATGACATTTCAGCTAAACTATATATATTCTTATTCCCTTTAAATGATATTCCTCCATTATTTCTCCGATGAAGCGGCCGTGGTATTTGAGCGTTTTCTTTTGGCTGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011468
ATGGTTCAAGGATCAATCGATTTCATATTCGGCAATGCAAGATCACTCTATAAGGAATGCAGCCTCTCCGTGGTGGGGCAATCATTTGCCATAGCTGCCCAGCGTAGACAATCCGGCAACGACGATGGAGTTTTTTCCTTTGTGAACTGCACAGTACATGGAGCTGGAGCTGTCTTCTTGGGCAGAGCCTGGGGAGAATATTCAAGAATAATATATGCATATAGTGAGCTCGACATAGACGTAAAACCACAGGGATGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795246.1
MVQGSIDFIFGNARSLYKECSLSVVGQSFAIAAQRRQSGNDDGVFSFVNCTVHGAGAVFLGRAWGEYSRIIYAYSELDIDVKPQGWDDWGKPSRQKTVLFGEYMCRGKGADRSGRVAWSKALTRQEAQPYLDSTFIAAKQWLRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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