当前解析结果
SmilChr02G001067| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001067 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001067 |
| 描述 | probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 18990958 - 18997191 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008094 |
|---|---|
| GeneID | 131008094 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008094 |
| 原始查询 | SmilChr02G001067 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470 |
| 产物 | probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470 |
| Arabidopsis | AT1G06470 (AT1G06470)Nucleotide/sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837159] identity=71.7; qcov=0.769; evalue=1.88e-56; confidence=high |
| Rice | Os06g0153200- identity=75; qcov=0.769; evalue=1.71e-58; confidence=high |
| GO | GO:0005793 (endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005801 (cis-Golgi network); GO:0015297 (antiporter activity); GO:0015786 (UDP-glucose transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008094 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057790977.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057790977.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.60000 | XP_057790977.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790977.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790977.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:18990962 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C8 |
Chr2:18991034 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B61,C50 |
Chr2:18991133 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:18996840 |
AAG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A14,B111,B128,B18,B2,B26,B31,B41,B44,C26,C60,D1,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。