当前解析结果
SmilChr02G001071| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001071 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001071 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001071 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 19076594 - 19077112 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008096 |
|---|---|
| GeneID | 131008096 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008096 |
| 原始查询 | SmilChr02G001071 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008096 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790978.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057790978.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057790978.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.20000 | XP_057790978.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057790978.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:19076604 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,C12 |
Chr2:19076608 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B104,C14,C24 |
Chr2:19076624 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,B104,B20 |
Chr2:19076675 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B5,C33 |
Chr2:19076695 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 23 | A2,A7,A8,B100,B117,B120,B122,B25,B27,B34,B38,B39,B58,B68,B94,B97,C13,C16,C19,C54,C59,C61,C70 |
Chr2:19076709 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B132,B53,B71,C20 |
Chr2:19076717 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B129,B137,B80,B91,C25 |
Chr2:19076731 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B5,B72,B8,B91,C47 |
Chr2:19076771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B80,B95,B98 |
Chr2:19076776 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B66 |
Chr2:19076776 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr2:19076781 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B90,B92 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。