Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001077`

染色体: Chr02 坐标: 19305736-19307784 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001077`
名称	SmilChr02G001077
描述	uncharacterized SmilChr02G001077
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	19305736 - 19307784 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008097`
GeneID	`131008097`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008097`
原始查询	`SmilChr02G001077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.7; qcov=0.101; evalue=1.77e-06; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=29.8; qcov=0.138; evalue=3.88e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008097

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790979.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790979.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790979.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057790979.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:19305745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:19305750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B26,C13,C17,C33
`Chr2:19305762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B70,B71,B72,C62
`Chr2:19305774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:19305776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B21,B84,B95,C58
`Chr2:19305779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,D8
`Chr2:19305784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:19305822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B36,B40
`Chr2:19305831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B87
`Chr2:19305854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B54,C15,C56,C65
`Chr2:19305920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr2:19305983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934996.1
ATGGCCGAGGAATCGAGAGATGAGGAGGGGACTATAGTCAGAACTACTCCGATGCAAACTCCTTCTGCCCAAGACGATAAGTTGGACAAGCTGTGCAACATGTTCGAGAAATTCATGACGAACCAGGGAACACCTAATCAAGGGACTCCCAACATTCGAAAGCCTGTGAAGGCATGCCAACTTTGCATGGCAAATTCGCATGCAACCGATGAATGTCCACAAGTTTTCGAAGAGGAAGAGCTTAATGCTATTGGGCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008097
ATGGCCGAGGAATCGAGAGATGAGGAGGGGACTATAGTCAGAACTACTCCGATGCAAACTCCTTCTGCCCAAGACGATAAGTTGGACAAGCTGTGCAACATGTTCGAGAAATTCATGACGAACCAGGGAACACCTAATCAAGGGACTCCCAACATTCGAAAGCCTGTGAAGGCATGCCAACTTTGCATGGCAAATTCGCATGCAACCGATGAATGTCCACAAGTTTTCGAAGAGGAAGAGCTTAATGCTATTGGGCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790979.1
MAEESRDEEGTIVRTTPMQTPSAQDDKLDKLCNMFEKFMTNQGTPNQGTPNIRKPVKACQLCMANSHATDECPQVFEEEELNAIGQQPGGNNGGQYQKPFEPYKQQFNNQGWRQHENLRYDNNNFLGPNQGQTSNPPQYSQQPQQARGSSLSELVHQMAQQQVKFQQETEKFIMETREGMQNVNSQLSHLAQAVARLESKQGELHSQVEVKKVNAMTLRGGKELPEVVNKKSQEEPEINEEVGMGSADEEEFAQEREAKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器