当前解析结果
SmilChr02G001078| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001078 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001078 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001078 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 19324036 - 19325001 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008098 |
|---|---|
| GeneID | 131008098 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008098 |
| 原始查询 | SmilChr02G001078 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os09g0122300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os09g0122300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os09g0122300- identity=36.2; qcov=0.358; evalue=1.15e-08; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008098 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057790981.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057790981.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057790981.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790981.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790981.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:19324059 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr2:19324073 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B23,B4,C44,D3 |
Chr2:19324077 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,C44,D3 |
Chr2:19324289 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B23,C63,C86,D3 |
Chr2:19324303 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B18 |
Chr2:19324323 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr2:19324330 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C37,C54,C63 |
Chr2:19324333 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B9,C26 |
Chr2:19324334 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B7 |
Chr2:19324339 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 41 | A13,A14,A19,A24,A6,B10,B101,B102,B106,B119,B124,B125,B134,B136,B2,B26,B28,B32,B34,B37,B42,B43,B55,B71,B72,B74,B77,B93,B95,C14,C33,C37,C38,C39,C43,C50,C54,C62,C63,C68,D11 |
Chr2:19324344 |
GCC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B100,B110,B119,C44,C71,C82 |
Chr2:19324360 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B75,C13,C19,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。