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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001085`

染色体: Chr02 坐标: 19444271-19446525 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001085`
名称	SmilChr02G001085
描述	AP2-like ethylene-responsive transcription factor PLT2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	19444271 - 19446525 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008099`
GeneID	`131008099`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008099`
原始查询	`SmilChr02G001085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP2-like ethylene-responsive transcription factor PLT2
产物	AP2-like ethylene-responsive transcription factor PLT2
Arabidopsis	`AT1G51190` (PLT2) Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841542] identity=67.5; qcov=0.317; evalue=1.59e-22; confidence=low
Rice	`Os02g0614300` (OsPLT3) - identity=42.4; qcov=0.728; evalue=5.31e-29; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008099

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790982.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790982.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790982.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790982.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790982.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:19444799`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B83
`Chr2:19444799`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B83
`Chr2:19444820`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B111,C1
`Chr2:19444820`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B111,C1
`Chr2:19444864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr2:19444915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B131
`Chr2:19444975`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B103,B59,B81,C57,C63,C67
`Chr2:19444978`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B103,B59,B81,C57,C63,C67
`Chr2:19444983`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A22,A4,B121,B131,B50,B56,B57,B73,B96,B98,C43,C46,D4
`Chr2:19445041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:19445095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A23,B102,B130,B137,B76,C29,D6
`Chr2:19445103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934999.1
ATGGTCGCCTCATCCTCGACTTTTTGTGCAAAGAGTCTGGAGACGAAGTTCTTGACCCTGTGTCTGGAGCTCTTCAATACTCCGGACTTCTCAAACGGTGTCAACTTCGCCTTGTGCAGCGCCGACTCTCGCGTGGGAAGAAACAACATCAATGCAGTTGCCTACACGCTGGGGAACGAAATTGCCGAATTCAGTCGGTTCCAAAACGTCTCTATTCGCCGCGGCTCTCTTGGCACAGAAGAGGAAGCTGCAGAAGCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008099
ATGGTCGCCTCATCCTCGACTTTTTGTGCAAAGAGTCTGGAGACGAAGTTCTTGACCCTGTGTCTGGAGCTCTTCAATACTCCGGACTTCTCAAACGGTGTCAACTTCGCCTTGTGCAGCGCCGACTCTCGCGTGGGAAGAAACAACATCAATGCAGTTGCCTACACGCTGGGGAACGAAATTGCCGAATTCAGTCGGTTCCAAAACGTCTCTATTCGCCGCGGCTCTCTTGGCACAGAAGAGGAAGCTGCAGAAGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790982.1
MVASSSTFCAKSLETKFLTLCLELFNTPDFSNGVNFALCSADSRVGRNNINAVAYTLGNEIAEFSRFQNVSIRRGSLGTEEEAAEAYDIAAIKFGGLNAVTNFEINRYDVKSILESTTLPIGAAKRLRRQEEMVLNLRWANESSLNLATYAKPNGGHMSWPNIAFQQAQPLVGAAYPYNHQHLWCKPELDSEINHGLHNFLQPSSVLHNIMTVDSSNMEHGYGSTAVMSGTTITVIISVSYWL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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