当前解析结果
SmilChr02G001087| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001087 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001087 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001087 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 19496828 - 19501964 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011487 |
|---|---|
| GeneID | 131011487 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011487 |
| 原始查询 | SmilChr02G001087 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011487 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795262.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057795262.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057795262.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795262.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795262.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:19500849 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr2:19500865 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B36,B42,B88,C12,C67 |
Chr2:19500870 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B15,B76,C45 |
Chr2:19500968 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B13 |
Chr2:19500968 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr2:19500972 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B29,B31,B4,B44,D1 |
Chr2:19500973 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C36 |
Chr2:19500985 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr2:19500989 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B29,B31,B4,B44,D1 |
Chr2:19500990 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr2:19500996 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B77,B85,B94,B99,C52 |
Chr2:19501028 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。