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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001099`

染色体: Chr02 坐标: 19810528-19812993 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001099`
名称	SmilChr02G001099
描述	uncharacterized SmilChr02G001099
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	19810528 - 19812993 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008106`
GeneID	`131008106`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008106`
原始查询	`SmilChr02G001099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=28; qcov=0.509; evalue=1.98e-35; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=32.3; qcov=0.713; evalue=4.21e-84; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008106

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790988.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790988.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790988.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790988.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:19810529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr2:19810531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr2:19810575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr2:19810580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	86	A1,A13,A15,A16,A23,A25,A6,A9,B10,B108,B11,B110,B117,B119,B12,B125,B128,B13,B130,B132,B138,B16,B18,B19,B23,B24,B26,B4,B40,B52,B54,B59,B60,B61,B63,B68,B73,B81,B86,B87,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B98,B99,C1,C10,C2,C21,C23,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C35,C36,C40,C41,C44,C46,C47,C5,C54,C6,C63,C64,C66,C68,C7,C73,C74,C75,C78,C83,C86,C87,D10,D5,D8,D9
`Chr2:19810591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B47,C42
`Chr2:19810591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C42
`Chr2:19810596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B137,B33,C36
`Chr2:19810602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr2:19810655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr2:19810657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C35
`Chr2:19810671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,D8
`Chr2:19810676`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B133,B45,B53,C64,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790988.1

821 aa

410

821

RVT_1

PF00078 RVT_1 195-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790988.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	195	455	3.6e-31	109.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935005.1
ATGAAGATTCAGTTGAAGATTGCTGATGAAGGTTATTCCGACTTGCTTTTTGTCCAAGAAGTCGCTGCCCAGGCGAGGATCGGCACCTTGCTAACACGTAAGAGCAATCTCATGCAACAGAAAAGTAGAGTTCGATGGCTTAAAGATGGTGACAGGAACACAAGTTTCTTCCATAAATCTTACAAGATGAGACGCAAGAATCTGATCCTTTCTCAACTCAAGATTGATGGTGTTGATACTTTTGAGCAGGACGTTATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008106
ATGAAGATTCAGTTGAAGATTGCTGATGAAGGTTATTCCGACTTGCTTTTTGTCCAAGAAGTCGCTGCCCAGGCGAGGATCGGCACCTTGCTAACACGTAAGAGCAATCTCATGCAACAGAAAAGTAGAGTTCGATGGCTTAAAGATGGTGACAGGAACACAAGTTTCTTCCATAAATCTTACAAGATGAGACGCAAGAATCTGATCCTTTCTCAACTCAAGATTGATGGTGTTGATACTTTTGAGCAGGACGTTATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790988.1
MKIQLKIADEGYSDLLFVQEVAAQARIGTLLTRKSNLMQQKSRVRWLKDGDRNTSFFHKSYKMRRKNLILSQLKIDGVDTFEQDVISSHIVDFFSKLFYEVTTNTVMVQDIQQIVEAMVSQKQNESLSCIPEEEEIKAAVFDLASDGAAGPDGFSGTFFQNCWDTIKDDIVVAAKTFFIKNYLPQGLNSNTLILIPKKEVVETVADLRPIVLSNFFFKVLSKIIATRLSSVAADNVTHNQFGFIRGRLIHDCIMLGLEGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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