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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001114`

染色体: Chr02 坐标: 20105086-20108848 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001114`
名称	SmilChr02G001114
描述	beta-1,2-xylosyltransferase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	20105086 - 20108848 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011509`
GeneID	`131011509`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011509`
原始查询	`SmilChr02G001114`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-1,2-xylosyltransferase
产物	beta-1%2C2-xylosyltransferase
Arabidopsis	`AT5G55500` (XYLT) beta-1,2-xylosyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835643] identity=60.8; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0503800` (RCN11) - identity=58.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04577 (Glyco_transf_61)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011509

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057795271.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057795271.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795271.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795271.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795271.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:20105841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B136,B55
`Chr2:20105960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:20107253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C13,C17
`Chr2:20108297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:20108453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795271.1

506 aa

253

506

Glyco_transf_61

PF04577 Glyco_transf_61 354-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795271.1`	Pfam	`PF04577`	Glyco_transf_61	Family	354	455	1.6e-10	42.1	Glycosyltransferase 61

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939288.1
ACTTGAGTTGAGTTTAGTTAAGTTTTGTAATTTTAAACACAGCAAACCAGAGAGAGAAAGAGTGAGAGGAGAGAGAGAAGAGAGAATGAAAACATGAAGAGCAAGACGCTGAAAATTGTGCTGGCTCTTTTCGCACTCAACTCCGTCTCTCTCTACCTCTACTTCTCCTCCCACCCCGACCACCGCTCACCCCCAAACAACTACGCCGCCTTGGGCTATTCCCAGCCCCACCGCCCCCTCTCCGTCAAACCCTGGCCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011509
ATGAAGAGCAAGACGCTGAAAATTGTGCTGGCTCTTTTCGCACTCAACTCCGTCTCTCTCTACCTCTACTTCTCCTCCCACCCCGACCACCGCTCACCCCCAAACAACTACGCCGCCTTGGGCTATTCCCAGCCCCACCGCCCCCTCTCCGTCAAACCCTGGCCGATTTTGCCCTCCTACCTCCCCTGGTCCCCCAACCCCGACACCAAATTCCGCTCTTGCGAAGCCTTTTTCGGCAACGGCTTCACTCAGCGCGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795271.1
MKSKTLKIVLALFALNSVSLYLYFSSHPDHRSPPNNYAALGYSQPHRPLSVKPWPILPSYLPWSPNPDTKFRSCEAFFGNGFTQRVDPLKPSPEPHRKVLPGGVGGGWFRCYYSKTLRSSVCEGGRIRMIPEKIGMSHGGEKLESVIGRGESEELPDFEDGAFQIEVADRSRIGKEMVDQGFLNKFVEEGAIGRHTMRGLISSIRLVDADEFVCSQWIEEPAVLVTRFEYANLFHTVTDWYSAYVASRVTGLPNRPHLVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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