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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001124`

染色体: Chr02 坐标: 20369322-20370405 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001124`
名称	SmilChr02G001124
描述	small ubiquitin-related modifier 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	20369322 - 20370405 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011528`
GeneID	`131011528`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011528`
原始查询	`SmilChr02G001124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small ubiquitin-related modifier 1-like
产物	small ubiquitin-related modifier 1-like
Arabidopsis	`AT5G55160` (SUMO2) small ubiquitin-like modifier 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835609] identity=90.1; qcov=0.91; evalue=2.57e-56; confidence=high
Rice	`Os01g0918300` (smt3) - identity=85.4; qcov=0.96; evalue=2.17e-56; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0031386 (protein tag activity); GO:0044389 (ubiquitin-like protein ligase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00240 (ubiquitin); PF11976 (Rad60-SLD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011528

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795294.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795293.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057795294.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057795294.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795293.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:20370016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:20370174`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A3,A8,B100,B113,B114,B120,B20,B25,B27,B34,B35,B38,B39,B5,B55,B56,B58,B68,B96,B97,C13,C19,C22,C54,C59,C60,C70,C74,C82,C85,D5,D9
`Chr2:20370175`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C17
`Chr2:20370175`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C17
`Chr2:20370206`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A14,A18,A2,B1,B101,B103,B106,B127,B129,B135,B137,B20,B22,B32,B51,B53,B56,B6,B69,B71,B75,B84,B97,C20,C25,C31,C53,C82,C84,D1,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795293.1

107 aa

107

Rad60-SLD

ubiquitin

PF11976 Rad60-SLD 17-74 aa PF00240 ubiquitin 19-75 aa

XP_057795294.1

100 aa

100

Rad60-SLD

ubiquitin

PF11976 Rad60-SLD 17-87 aa PF00240 ubiquitin 19-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795293.1`	Pfam	`PF11976`	Rad60-SLD	Family	17	74	2.1e-19	69.8	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like
`XP_057795293.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	19	75	1.1e-11	45.0	Ubiquitin family
`XP_057795294.1`	Pfam	`PF11976`	Rad60-SLD	Family	17	87	1.5e-26	92.7	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like
`XP_057795294.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	19	89	1.8e-16	60.4	Ubiquitin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939311.1
TCCAACTGTAGCACGAGTTTTTTAACAAAATGAATTAATTCGAATTCCAATAACATTACAGCGATTGGCGAAGCGTGAAACCAAAACAGCTCATCTAGTCATCTTATTTGTGCCCATGAAAAATCGAAAACGATTCCTTCATTTCTAGAAAACAATTAGGTAGCTTACTTACTACGCAGAGTGTATCAGAATTCGAGGACTTACGCCCCAATTCCAACCGTCGATCACACACCAAACAATTTCAGCCACTCATCAATTCC...

XM_057939310.1
CATGAAAAATCGAAAACGATTCCTTCATTTCTAGAAAACAATTAGGTAGCTTACTTACTACGCAGAGTGTATCAGAATTCGAGGACTTACGCCCCAATTCCAACCGTCGATCACACACCAAACAATTTCAGCCACTCATCAATTCCCGCTTTATTGAAAACATCCAAATAAAAATTTCGAAATATATATAAAGCCTAGCCTTACTTTCACAAGTTGCCTGCCTTAATACAATCGGCGCCGCCTGTGACAATGTCTAGCGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011528
ATGTCTAGCGTTGAAGACGACAAGAAGCCAGCAGATTCGTCGGCACACATCAATCTCAAAGTCAAAGGCCAGGACGGAAACGAAGTATTTTTCAGGATCAAGAGAAGCACGCAAGTGAAGAAGCTGATGAATGCTTATTGCGACCGACAATCAGTTGATTTCAACTCTATCGCATTCCTATTTGATGGTCGTCGTCTCCGAGGGGAGCAGACTCCAGATGAGCTGGAGATGGAAGATGGTGATGAGATAGATGCAATGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795293.1
MSSVEDDKKPADSSAHINLKVKGQDGNEVFFRIKRSTQVKKLMNAYCDRQSVDFNSIAFLFDGRRLRGEQTPDEVRALSLSFCFSINTRGGLIYLIFYYFAAGDGRW

XP_057795294.1
MSSVEDDKKPADSSAHINLKVKGQDGNEVFFRIKRSTQVKKLMNAYCDRQSVDFNSIAFLFDGRRLRGEQTPDELEMEDGDEIDAMLHQTGGTLFYCATI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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