当前解析结果
SmilChr02G001129| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001129 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001129 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001129 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 20416119 - 20416822 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008116 |
|---|---|
| GeneID | 131008116 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008116 |
| 原始查询 | SmilChr02G001129 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008116 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790997.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057790997.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057790997.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790997.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790997.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:20416178 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B138,B21,B60,B79 |
Chr2:20416196 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,C19 |
Chr2:20416211 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,B82 |
Chr2:20416229 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B24 |
Chr2:20416229 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr2:20416244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B18,C64,C75 |
Chr2:20416264 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr2:20416270 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | D10,D5 |
Chr2:20416306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B125,B13 |
Chr2:20416317 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 33 | A15,A25,A3,A5,B100,B106,B11,B110,B117,B132,B136,B19,B2,B20,B45,B56,B7,B89,B94,B96,B97,C11,C13,C32,C45,C46,C53,C68,C69,C7,C70,C87,D4 |
Chr2:20416325 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B62,B9 |
Chr2:20416337 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | A21,A9,B117,B119,B138,B66,B87,C22,C50,C64 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。