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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001159`

染色体: Chr02 坐标: 21152597-21153340 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001159`
名称	SmilChr02G001159
描述	uncharacterized SmilChr02G001159
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	21152597 - 21153340 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008123`
GeneID	`131008123`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008123`
原始查询	`SmilChr02G001159`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=27.6; qcov=0.759; evalue=1.45e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008123

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791004.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791004.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791004.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791004.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791004.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:21152624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B110,B138,B82,D3
`Chr2:21152630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B2,C19
`Chr2:21152638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B121,C4,C60
`Chr2:21152663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr2:21152668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B65
`Chr2:21152675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A19,A4,A7,B16,B18,B28,B30,B48,B67,B72,B84,B88,C10,C16,C34,C42,C53,C62,C64,C66,C70,D1,D2,D7
`Chr2:21152713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B50,B7,B8,B80
`Chr2:21152727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C4,C60
`Chr2:21152731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr2:21152734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:21152740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:21152747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791004.1

220 aa

110

220

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 39-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791004.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	39	113	4.6e-11	43.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935021.1
ATGCCTCCACGAAGAGTGTACAGAAATGTACCCGTGAATGAGGAAGAACACAGAGAACCTACGCCGCCGCCCCCACCTCAAGATAGGAGGGTGGAAGAACTTTTCTTAAGACAGAACCCCCCGACTTTCGCAGGCACGGGAGACCCTGCTGAAACGGAAGAATGGATTCATGCTATGGAACGAATCTTTCGATTTTTGAGATGCAACGACGCAGAACGTCTTATGTGCGTGTCTTACCAGTTGAAAGGAACCGCCGACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008123
ATGCCTCCACGAAGAGTGTACAGAAATGTACCCGTGAATGAGGAAGAACACAGAGAACCTACGCCGCCGCCCCCACCTCAAGATAGGAGGGTGGAAGAACTTTTCTTAAGACAGAACCCCCCGACTTTCGCAGGCACGGGAGACCCTGCTGAAACGGAAGAATGGATTCATGCTATGGAACGAATCTTTCGATTTTTGAGATGCAACGACGCAGAACGTCTTATGTGCGTGTCTTACCAGTTGAAAGGAACCGCCGACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791004.1
MPPRRVYRNVPVNEEEHREPTPPPPPQDRRVEELFLRQNPPTFAGTGDPAETEEWIHAMERIFRFLRCNDAERLMCVSYQLKGTADYWWEAKQKTMAPEQLDELTWELFKTALLEYDRLFCDLARYTPYRVDTDEKMSELFCAGLRQEIRVVLASQTALSYAEALNRALDMELAMQPEKTTHAPTPPSAQYTQVSNTPYSNQGQKGKRKWENRGNEGKKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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