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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001163`

染色体: Chr02 坐标: 21213127-21221057 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001163`
名称	SmilChr02G001163
描述	uncharacterized SmilChr02G001163
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	21213127 - 21221057 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011517`
GeneID	`131011517`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011517`
原始查询	`SmilChr02G001163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835597]; symbol=AT5G55060; hit=AT5G55060; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835597]; symbol=AT5G55060; hit=AT5G55060; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G55060` (AT5G55060) Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835597] identity=50.3; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0511000` - identity=48.1; qcov=0.837; evalue=1.95e-156; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0043547 (positive regulation of GTPase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13890 (Rab3-GTPase_cat)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011517

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057795279.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057795279.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057795279.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057795279.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057795279.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:21213417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A21,A23,A25,B113,B123,B130,B16,B26,B27,B28,B4,B44,B5,B54,B62,B83,B85,C11,C18,C31,C46,C5,C67,C69,C73,C80,C83
`Chr2:21213440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B98
`Chr2:21213530`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr2:21213530`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr2:21213570`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr2:21213570`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr2:21213862`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B64
`Chr2:21213862`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B64
`Chr2:21214407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:21217324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:21218428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:21219761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795279.1

679 aa

340

679

Rab3-GTPase_cat

PF13890 Rab3-GTPase_cat 372-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795279.1`	Pfam	`PF13890`	Rab3-GTPase_cat	Family	372	522	4.3e-52	176.7	Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939296.1
GATTGCCCATTACTCTAATAAAAATAAAAATAAAAACAAAAACAATAAAAAGTAAAAATAGGAAGTCCACATTTTACTAGTGTGGAACCGCGGCGTAGTTGCAGTATCAGACTCAGACTATCAAGTCAGCATATTTCTTGGTTCAATTTATCCGAATTCATCTTCGATTCCGCGCTCCGCGGCTATGGCATCGGTTTCGTGATACGCGCCGTATCATTTCCCCCACCGCTGACAATGGAGGCGTCCTTCGTATCCAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011517
ATGGAGGCGTCCTTCGTATCCAGAGCTCGGACAGCCATCAATTCCGCCGCAGCTAAAGCGGAGAAAGTCTTGACGGACATTAAAAAATCTGATTCCAACGCGCATCGCGATTTGGATAAACAATCGCCTGTCGCGTCAACGGCGGAGTGTCCGAGGGATGCGGATGAGCCGAAGGTGCAGGATTCCGAAGGAGCAAACAATAAGAGAGTGCGGCCCCAGCCAATAAAAACCAAGCAGGATTGGCATGAGAGATTGAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795279.1
MEASFVSRARTAINSAAAKAEKVLTDIKKSDSNAHRDLDKQSPVASTAECPRDADEPKVQDSEGANNKRVRPQPIKTKQDWHERLRNLRLGKKGAEESGKPDNSTNTMAYAIFDDNLYLMHERGFSHPNDLEEELESSKAAKADIIPSSAILKQLAVAVEAGSGYSTMKDLLASSKNSSPIREKASMSISVMKSLVLREKDDKMIQEFGSDDKVLGLMNALINAEGEFTGRTVPGLETQINSTSLVKDIHGAPLESFVVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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