当前解析结果
SmilChr02G001168| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001168 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001168 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001168 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 21441617 - 21445151 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008128 |
|---|---|
| GeneID | 131008128 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008128 |
| 原始查询 | SmilChr02G001168 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008128 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057791007.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057791007.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057791007.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791007.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791007.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:21441625 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,C2 |
Chr2:21441631 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | D3,D7 |
Chr2:21441631 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | D3,D7 |
Chr2:21441635 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,A9,B135,B76,B77 |
Chr2:21441650 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr2:21441651 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
Chr2:21441750 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B135,B78,C45 |
Chr2:21441751 |
CA |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A20,B20,C38,C48,C8 |
Chr2:21441778 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr2:21441781 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B135,B78,C45 |
Chr2:21441799 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B82 |
Chr2:21441838 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。