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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001194`

染色体: Chr02 坐标: 21966207-21968919 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001194`
名称	SmilChr02G001194
描述	reactive Intermediate Deaminase A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	21966207 - 21968919 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011572`
GeneID	`131011572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011572`
原始查询	`SmilChr02G001194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	reactive Intermediate Deaminase A, chloroplastic
产物	reactive Intermediate Deaminase A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G20390` (AT3G20390) endoribonuclease L-PSP family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821584] identity=72.6; qcov=1.02; evalue=3.29e-87; confidence=high
Rice	`Os07g0516200` (P0048D08.132) - identity=76.4; qcov=0.882; evalue=8.38e-77; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0019239 (deaminase activity); GO:1901565 (GO:1901565)
KEGG	-
Pfam	PF01042 (Ribonuc_L-PSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795324.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057795324.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057795324.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795324.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795324.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:21966856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:21967592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr2:21967597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:21968068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:21968587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:21968648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:21968652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795324.1

187 aa

187

Ribonuc_L-PSP

PF01042 Ribonuc_L-PSP 69-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795324.1`	Pfam	`PF01042`	Ribonuc_L-PSP	Domain	69	185	3.8e-40	137.4	Endoribonuclease L-PSP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939341.1
CTAGTGTATATAGGCCAAGTAATGTGTTGTAAGGTGAAGCTCATCCTAGTGTATATAGGCCCAAGTATTTCATCAATTGAGCTTTTTCTTAGACATATTTTAGGCCTAAAGCCCATGATGACTAATAAGAGACCACCAATCCATACACACACAGTCGCACAGTGGTCGATAGTTTCATACTTCAAGACTGAGAAAGACTAATGGCGTGGTGCGCCGCCGCGAGGAGCTTCCACATGCCGGCGATCGATGTCGGCTCTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011572
ATGGCGTGGTGCGCCGCCGCGAGGAGCTTCCACATGCCGGCGATCGATGTCGGCTCTCTACGCTCTCGGGCGCCCTTAGCCGCCGGAATCGGCTGCGTTTCCTTGGCTGGTGCTAACTTCCGCCGCTCCGGCCCGTCGCCGCCTTTTGCTTCGTTAGGCATCTCTACTGATTCCACTCCTGTTTTGAAGGAAGCTGTTCAGACAGATAAAGCTCCGGCAGCATTGGGGCCGTATTGTCAAGCCATCAAAGCAAATAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795324.1
MAWCAAARSFHMPAIDVGSLRSRAPLAAGIGCVSLAGANFRRSGPSPPFASLGISTDSTPVLKEAVQTDKAPAALGPYCQAIKANNMLFMSGCLGLVPETGKFVSDSVEDQTEQVLKNMGEILKASGASYASVVKTTIMLADLKDFKKVNEIYAKYFPAPAPARSTYQVAALPLDARIEIECIATLQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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