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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001198`

染色体: Chr02 坐标: 22117936-22121739 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001198`
名称	SmilChr02G001198
描述	NEP1-interacting protein-like 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22117936 - 22121739 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011575`
GeneID	`131011575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011575`
原始查询	`SmilChr02G001198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NEP1-interacting protein-like 1
产物	NEP1-interacting protein-like 1
Arabidopsis	`AT3G20395` (AT3G20395) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008015] identity=46.1; qcov=0.845; evalue=3.7e-54; confidence=high
Rice	`Os10g0544600` - identity=39.2; qcov=0.858; evalue=4.83e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF14634 (zf-RING_5); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057795325.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057795325.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057795325.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795325.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22118532`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr2:22118532`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr2:22118602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:22121181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:22121188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C39
`Chr2:22121496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A19,A4,B101,B12,B16,B18,B30,B36,B48,B56,B62,B67,B84,B88,B96,B99,C16,C34,C47,C53,C56,C59,C64,C66,C70,C81,D1,D2,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795325.1

226 aa

113

226

zf-rbx1

zf-RING_2

zf-RING_11

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

zf-RING_5

PF12678 zf-rbx1 165-208 aa PF13639 zf-RING_2 165-208 aa PF17123 zf-RING_11 166-194 aa PF13445 zf-RING_UBOX 166-201 aa PF00097 zf-C3HC4 166-207 aa PF13923 zf-C3HC4_2 166-207 aa PF14634 zf-RING_5 166-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795325.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	165	208	2e-08	35.1	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057795325.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	165	208	1.4e-14	54.8	Ring finger domain
`XP_057795325.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	166	194	6.4e-11	42.5	RING-like zinc finger
`XP_057795325.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	166	201	1.2e-05	25.9	RING-type zinc-finger
`XP_057795325.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	166	207	7.1e-07	29.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057795325.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	166	207	3.7e-09	37.0	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057795325.1`	Pfam	`PF14634`	zf-RING_5	Domain	166	209	2.7e-08	34.4	zinc-RING finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939342.1
ATGAAAATGAGTATTTAGCAATTAAGAGATATGGATGTGAATAGCAGCCCTCGAGCTTGGATTAACCAACTTTAATGCTTCCCTCTCAGCTCAGCATCTACTCATGATACTTCCCCCCCTTCTATATATTCCCCATTCTTCCCATCATATATTTGTCAACCACTTAAATTTATCTTCTCGAAATTAATATATAATTTAATTGAAGTAGTTTTCCAGAAATGTTAAAGATCAGCTGGAGCTCCTACAGCATGTCCTTGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011575
ATGTTAAAGATCAGCTGGAGCTCCTACAGCATGTCCTTGATATGGAGAAGACTGAATGATGTTTTGTTGAAGCTCATCAACAAATTCTCTGTCGCTCTTTTTACTTGTACCTTTGCTTTAGGTGGAGCTGCAGTGGGGGCGATTGCCGGAGCAATCAAAGGGCAGACGACGGAAACCGGCCTCTCGCGTGGCTTCGTTGTAGGAGCGGTGGCGGGGGCCGTCACCGCCGTCCAATTGATGGACCTTGTCGTAAATGGACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795325.1
MLKISWSSYSMSLIWRRLNDVLLKLINKFSVALFTCTFALGGAAVGAIAGAIKGQTTETGLSRGFVVGAVAGAVTAVQLMDLVVNGLPFPKVALIRSLINGKVFREWVSPALLKAYQWQMSAIDTSEREFSDIFDIHTLNGLSQDSIKELPIHNFNGTTSYSNTSCSICLEDLKNGEVVRWLPRCKHIFHVECVDEWLMRQGSCPICRKNVSSPHIQDSTLFKYAN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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