当前解析结果
SmilChr02G001199| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001199 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001199 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001199 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 22137077 - 22137821 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008135 |
|---|---|
| GeneID | 131008135 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008135 |
| 原始查询 | SmilChr02G001199 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008135 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791013.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057791013.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791013.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791013.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057791013.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:22137087 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,C82 |
Chr2:22137108 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr2:22137123 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr2:22137140 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B20,C86 |
Chr2:22137144 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,B96,D2 |
Chr2:22137149 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A13,C5 |
Chr2:22137156 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B123 |
Chr2:22137161 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,A5 |
Chr2:22137167 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B69 |
Chr2:22137175 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A4,B46,D4 |
Chr2:22137194 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 13 | B132,B137,B45,B58,B60,B87,C24,C29,C48,C52,C57,C72,D1 |
Chr2:22137205 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B17,B9,B92,C75,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。