当前解析结果
SmilChr02G001201| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001201 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001201 |
| 描述 | protein METABOLIC NETWORK MODULATOR 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 22150882 - 22155610 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011577 |
|---|---|
| GeneID | 131011577 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011577 |
| 原始查询 | SmilChr02G001201 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein METABOLIC NETWORK MODULATOR 1 |
| 产物 | protein METABOLIC NETWORK MODULATOR 1 |
| Arabidopsis | AT5G54930 (AT5G54930)AT hook motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835584] identity=33; qcov=0.907; evalue=3.5e-30; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF27637 (MNM1_beta) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011577 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795329.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795329.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795329.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795329.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057795329.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:22154127 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr2:22154263 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr2:22154465 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B57,B68,B72,D3 |
Chr2:22154682 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:22154702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B13,B16,B65,B89,C46 |
Chr2:22154937 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr2:22155048 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B107,B74 |
Chr2:22155181 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,C85 |
Chr2:22155248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057795329.1PF27637
MNM1_beta 64-100 aa
XP_057795330.1PF27637
MNM1_beta 64-100 aa
XP_057795331.1PF27637
MNM1_beta 64-100 aa
XP_057795332.1PF27637
MNM1_beta 64-100 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057795329.1 |
Pfam | PF27637 |
MNM1_beta | Domain | 64 | 100 | 2.1e-21 | 75.9 | Metabolic network modulator 1 small beta sheet domain |
XP_057795330.1 |
Pfam | PF27637 |
MNM1_beta | Domain | 64 | 100 | 2.1e-21 | 75.9 | Metabolic network modulator 1 small beta sheet domain |
XP_057795331.1 |
Pfam | PF27637 |
MNM1_beta | Domain | 64 | 100 | 2.1e-21 | 75.9 | Metabolic network modulator 1 small beta sheet domain |
XP_057795332.1 |
Pfam | PF27637 |
MNM1_beta | Domain | 64 | 100 | 2.1e-21 | 75.9 | Metabolic network modulator 1 small beta sheet domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。