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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001205`

染色体: Chr02 坐标: 22223374-22227993 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001205`
名称	SmilChr02G001205
描述	polyadenylate-binding protein RBP45
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22223374 - 22227993 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011580`
GeneID	`131011580`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011580`
原始查询	`SmilChr02G001205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein RBP45
产物	polyadenylate-binding protein RBP45
Arabidopsis	`AT1G11650` (RBP45B) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837708] identity=62.7; qcov=0.979; evalue=1.15e-153; confidence=high
Rice	`Os03g0569900` - identity=69.9; qcov=0.846; evalue=3.54e-164; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF13893 (RRM_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011580

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795335.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795335.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057795336.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057795335.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057795336.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22223669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:22223735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C2
`Chr2:22223765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C1
`Chr2:22224599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:22226524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:22227113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795335.1

396 aa

198

396

RRM_1

RRM_5

RRM_1

PF00076 RRM_1 64-131 aa PF00076 RRM_1 157-220 aa PF13893 RRM_5 250-335 aa PF00076 RRM_1 264-328 aa

XP_057795336.1

389 aa

194

389

RRM_1

RRM_5

RRM_1

PF00076 RRM_1 64-131 aa PF00076 RRM_1 157-220 aa PF13893 RRM_5 249-335 aa PF00076 RRM_1 264-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795335.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	64	131	5.7e-49	164.6	RNA recognition motif
`XP_057795335.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	157	220	5.7e-49	164.6	RNA recognition motif
`XP_057795335.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	250	335	1.8e-10	41.3	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057795335.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	264	328	5.7e-49	164.6	RNA recognition motif
`XP_057795336.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	64	131	5.3e-49	164.7	RNA recognition motif
`XP_057795336.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	157	220	5.3e-49	164.7	RNA recognition motif
`XP_057795336.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	249	335	1.7e-10	41.4	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057795336.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	264	328	5.3e-49	164.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939353.1
AAAAAGTTTATATTTTAAAATCGCGGCAAGAGACGATGCGACTTCAGTTAAATATAGGTTTGCAATAACGAGCCACCGATTAATTCCCTTCATAAAACACGAAACCCTATCGTATTTATTTGTCCGTTTCGTACTCGGAAGACCTCCTTTTCAAATCCCCAATTTTCCCGAGGTTTCAATTAGGGTTTAGCTCCAGTCGAGAATGATGCAGCAGCCAGGAGGGATGGCGCCACCACCTATGGGGATGGATCAGCAGCAAC...

XM_057939352.1
ATTCCCTTCATAAAACACGAAACCCTATCGTATTTATTTGTCCGTTTCGTACTCGGAAGACCTCCTTTTCAAATCCCCAATTTTCCCGAGGTTTCAATTAGGGTTTAGCTCCAGTCGAGAATGATGCAGCAGCCAGGAGGGATGGCGCCACCACCTATGGGGATGGATCAGCAGCAACCCCCTCAGCAGCAGTGGATGACGATGCCACCGCAGCCGCCTCACTTCTGGCCTCAGCAGCAGCAGCAACAGCACTACGGTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011580
ATGATGCAGCAGCCAGGAGGGATGGCGCCACCACCTATGGGGATGGATCAGCAGCAACCCCCTCAGCAGCAGTGGATGACGATGCCACCGCAGCCGCCTCACTTCTGGCCTCAGCAGCAGCAGCAACAGCACTACGGTGCGCCGCCAACCAACGCCGCCGCTGCTGGCGTAGCCGATGAGGTTCGATCTCTATGGATTGGGGACCTTCAGTACTGGATGGATGAGAACTATCTCACATCGTGCTTCTACAACACCGGCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795335.1
MMQQPGGMAPPPMGMDQQQPPQQQWMTMPPQPPHFWPQQQQQQHYGAPPTNAAAAGVADEVRSLWIGDLQYWMDENYLTSCFYNTGELVSAKVIRNKQTGQSEGYGFLEFRTHGAAENILQSYNTMMMPNAEQSFRLNWASLGAGDKRTDDSPEYTIFVGDLAGDVTDYTLQETFKAVYQSVKGAKVVIDRVTARSKGYGFVKFGDEREQQRAMSEMNGVLCSTRPMRIGPAANKKPMNAPTQNASYQNPQGTQGESDPN...

XP_057795336.1
MMQQPGGMAPPPMGMDQQQPPQQQWMTMPPQPPHFWPQQQQQQHYGAPPTNAAAAGVADEVRSLWIGDLQYWMDENYLTSCFYNTGELVSAKVIRNKQTGQSEGYGFLEFRTHGAAENILQSYNTMMMPNAEQSFRLNWASLGAGDKRTDDSPEYTIFVGDLAGDVTDYTLQETFKAVYQSVKGAKVVIDRVTARSKGYGFVKFGDEREQQRAMSEMNGVLCSTRPMRIGPAANKKPMNAPTQNASYQNPQGTQGESDPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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