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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001209`

染色体: Chr02 坐标: 22253258-22253737 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001209`
名称	SmilChr02G001209
描述	uncharacterized SmilChr02G001209
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22253258 - 22253737 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008138`
GeneID	`131008138`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008138`
原始查询	`SmilChr02G001209`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008138

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791015.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791015.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791015.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791015.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791015.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22253264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:22253291`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B1,B118,B132,B140,B43,B76,C50,C84,D9
`Chr2:22253332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B133,B73,B84,C14
`Chr2:22253372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr2:22253414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	163	A1,A13,A14,A18,A19,A2,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B102,B103,B105,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B137,B138,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B20,B22,B24,B25,B27,B3,B30,B33,B35,B39,B40,B41,B43,B46,B47,B48,B50,B51,B52,B53,B54,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B66,B68,B69,B71,B73,B75,B76,B78,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B94,B96,B97,B99,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C19,C2,C20,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C32,C35,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C48,C5,C53,C54,C56,C58,C59,C62,C63,C64,C65,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C85,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D6,D9
`Chr2:22253423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C5
`Chr2:22253431`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	B110,B117,B33,B37,B38,B39,B46,B55,B70,B78,B82,C12,C20,C23,C31,C71,C75,D1
`Chr2:22253432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A1,A20,A23,B12,B130,B139,B20,B4,B41,B57,B58,B75,B78,B79,C16,C20,C51,C52,C77,C82,D3,D4,D5
`Chr2:22253435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	B13,B132,B17,B55,B56,B60,B69,B74,B85,B96,C24,C29,C39,C40,C41,C52,C53,C57,C81,D11
`Chr2:22253440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B34,B61,D10
`Chr2:22253483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D4
`Chr2:22253505`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A20,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791015.1

159 aa

159

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 73-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791015.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	73	151	8.4e-06	27.1	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935032.1
ATGTTGGCAAAGGTGAATGTGAACTTACCTTTGCTAGATGTGATCAGGAATGTCCCAGCTTACTTGAAGTTTTTCAAAGAGTTGGCCTCCAAGAAGAGGAGGTTCGAGGACAACGAGAAGATTTTGGTGTCGGAGGTTGCAAACTCCATAATGCAACAGCCCTTACCGACCAAGCAACGAGACCCAGGTAGTTTTGTGATTAATATTGCTTTGGGAAATGGTAAGGAGGCCTCGGGAATGTTAGATTTGGGGGCTGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008138
ATGTTGGCAAAGGTGAATGTGAACTTACCTTTGCTAGATGTGATCAGGAATGTCCCAGCTTACTTGAAGTTTTTCAAAGAGTTGGCCTCCAAGAAGAGGAGGTTCGAGGACAACGAGAAGATTTTGGTGTCGGAGGTTGCAAACTCCATAATGCAACAGCCCTTACCGACCAAGCAACGAGACCCAGGTAGTTTTGTGATTAATATTGCTTTGGGAAATGGTAAGGAGGCCTCGGGAATGTTAGATTTGGGGGCTGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791015.1
MLAKVNVNLPLLDVIRNVPAYLKFFKELASKKRRFEDNEKILVSEVANSIMQQPLPTKQRDPGSFVINIALGNGKEASGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGNLKPTRMCLQLADRSVRYPHGVVEDILVRVGGLIVPVDFVVLEIGEVHENGKEHTLLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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