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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001231`

染色体: Chr02 坐标: 22603579-22604469 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001231`
名称	SmilChr02G001231
描述	monooxygenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22603579 - 22604469 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011606`
GeneID	`131011606`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011606`
原始查询	`SmilChr02G001231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monooxygenase 2-like
产物	monooxygenase 2-like
Arabidopsis	`AT4G38540` (AT4G38540) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830011] identity=48.2; qcov=0.787; evalue=1.95e-22; confidence=medium
Rice	`Os03g0154100` - identity=48.9; qcov=0.815; evalue=2.88e-20; confidence=low
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01266 (DAO); PF01494 (FAD_binding_3); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011606

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057795359.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795359.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057795359.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057795359.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22603922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C72
`Chr2:22603929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:22603933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B95,C41,C74
`Chr2:22603981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B77
`Chr2:22603988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C72
`Chr2:22604085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B69,C41,C74
`Chr2:22604113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C49
`Chr2:22604115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr2:22604119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B69,C74
`Chr2:22604146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C49
`Chr2:22604165`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B70
`Chr2:22604165`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795359.1

108 aa

108

DAO

FAD_binding_2

FAD_binding_3

NAD_binding_8

PF01266 DAO 13-60 aa PF00890 FAD_binding_2 13-71 aa PF01494 FAD_binding_3 13-82 aa PF13450 NAD_binding_8 16-46 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795359.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	13	60	2.6e-07	31.2	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057795359.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	13	71	6.4e-06	26.3	FAD binding domain
`XP_057795359.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	13	82	4.6e-08	33.4	FAD binding domain
`XP_057795359.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	16	46	9e-06	26.6	NAD(P)-binding Rossmann-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939376.1
AATCATCATTCCCTATAAAAGTAGAGCACACATTCATCCCAAACTTCAACTTCTCTTTTTCATCACGCTCTGATTTTTGGTAATGAAGAGTCAAATGGAACCCACAATCTACGAGCAAGATATGTTGATAGTCGGAGGCGGCATAGCTGGCCTCACCACAGCTCTCGGACTCCACAAGTTGGGGATTCGGAGCCTGGTTTTGGAAGCGTCGGATGGATTAAGAACCACGGGGTTCGCCCTAACCATGTGGACGAACGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011606
ATGAAGAGTCAAATGGAACCCACAATCTACGAGCAAGATATGTTGATAGTCGGAGGCGGCATAGCTGGCCTCACCACAGCTCTCGGACTCCACAAGTTGGGGATTCGGAGCCTGGTTTTGGAAGCGTCGGATGGATTAAGAACCACGGGGTTCGCCCTAACCATGTGGACGAACGCGTGGATAACTCTAGATATAGTCGGAATCGGCGACACCATGAGAGCCAATTCTCTCCCAATTGAAGGTTTTGAAGTCGGTAGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795359.1
MKSQMEPTIYEQDMLIVGGGIAGLTTALGLHKLGIRSLVLEASDGLRTTGFALTMWTNAWITLDIVGIGDTMRANSLPIEGFEVGSLDSGVFPASLVVKKVWVPPPTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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