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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001234`

染色体: Chr02 坐标: 22656557-22657604 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001234`
名称	SmilChr02G001234
描述	pre-mRNA-splicing factor sap145-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22656557 - 22657604 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011609`
GeneID	`131011609`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011609`
原始查询	`SmilChr02G001234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-splicing factor sap145-like
产物	pre-mRNA-splicing factor sap145-like
Arabidopsis	`AT4G21660` (AT4G21660) proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828253] identity=85.5; qcov=0.826; evalue=2.18e-43; confidence=medium
Rice	`Os02g0827300` - identity=82.9; qcov=0.826; evalue=6.03e-42; confidence=medium
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005684 (U2-type spliceosomal complex); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF04046 (PSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011609

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057795363.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795363.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057795363.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057795363.1`
5	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057795363.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22656918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:22656923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B21,C28,C74
`Chr2:22656937`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr2:22656937`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr2:22657151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:22657168`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B62,B66
`Chr2:22657168`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B62,B66
`Chr2:22657178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr2:22657279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B56,C2,D7
`Chr2:22657332`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B34
`Chr2:22657332`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795363.1

92 aa

PSP

PF04046 PSP 1-20 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795363.1`	Pfam	`PF04046`	PSP	Family	1	20	1.1e-07	32.2	PSP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939380.1
ATGAAGCCAGGGACATTGTCACATGAGTTAAAAGAGGCTCTAGGCATGCCTGATGGTGCCCCCCACCATGGCTCATCAATATGCAGAGATATGGTCCTCCACCTTCTTATCCTCATTTAAAAATCCCTGGCCTTAATGCACCAATCCCCGCTGGAGCTAAATTTGGCTATGGGCATGGAGAATGGGGCAAACCACCTGTTGATGAATATGGACGTCCCCTCTATGGAGATGTTTTCGGCTTTGTGCAACAAGAACAGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011609
ATGCAGAGATATGGTCCTCCACCTTCTTATCCTCATTTAAAAATCCCTGGCCTTAATGCACCAATCCCCGCTGGAGCTAAATTTGGCTATGGGCATGGAGAATGGGGCAAACCACCTGTTGATGAATATGGACGTCCCCTCTATGGAGATGTTTTCGGCTTTGTGCAACAAGAACAGCCCAATTATGAGGAAGAACCAGTTGATAAGACTAAGCACTGGGGTGACTTGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795363.1
MQRYGPPPSYPHLKIPGLNAPIPAGAKFGYGHGEWGKPPVDEYGRPLYGDVFGFVQQEQPNYEEEPVDKTKHWGDLEEEEEEEEEEEEEEEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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