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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001235`

染色体: Chr02 坐标: 22712094-22721130 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001235`
名称	SmilChr02G001235
描述	septum-promoting GTP-binding protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22712094 - 22721130 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011611`
GeneID	`131011611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011611`
原始查询	`SmilChr02G001235`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	septum-promoting GTP-binding protein 1-like
产物	septum-promoting GTP-binding protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G54840` (SGP1) Ras-related small GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835574] identity=55.6; qcov=1.01; evalue=7.2e-71; confidence=high
Rice	`Os07g0522900` - identity=66.7; qcov=0.516; evalue=9.26e-56; confidence=medium
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF05783 (DLIC); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795368.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057795369.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795368.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795368.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795368.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22712706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C41
`Chr2:22712724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:22715669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:22721061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795368.1

268 aa

134

268

Arf

Roc

Ras

DLIC

PF00025 Arf 83-169 aa PF08477 Roc 85-198 aa PF00071 Ras 85-248 aa PF05783 DLIC 214-254 aa

XP_057795369.1

221 aa

110

221

Arf

Ras

Roc

PF00025 Arf 83-168 aa PF00071 Ras 85-198 aa PF08477 Roc 85-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795368.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	83	169	3.7e-05	24.0	ADP-ribosylation factor family
`XP_057795368.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	85	198	5.5e-18	66.1	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057795368.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	85	248	1.2e-22	80.9	Ras family
`XP_057795368.1`	Pfam	`PF05783`	DLIC	Family	214	254	5e-06	26.4	Dynein light intermediate chain (DLIC)
`XP_057795369.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	83	168	3.1e-05	24.2	ADP-ribosylation factor family
`XP_057795369.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	85	198	4.3e-17	62.9	Ras family
`XP_057795369.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	85	198	4.6e-18	66.3	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939385.1
GTACAATTTGAATTGGTGGTGCATCGATTAAATGCAAATTGCAGCGTATTAAATTGATAAGCAGCTTAAAAAAGGTGAAAGCCATAAATACGGCATTACCTGCTTTCCCTCTGCAAGAAAGCAAACCACATCTCATCTCAATCTTAATATATGCAGCACACCACCACCTACCCCGCCGGAATCCGCCGGAAAATCGTAATCCGGTGGAGGTTAATAGAGAAGGCGGCCCTATTCCGGCAGTTCTTCAGAAGAATTCTTGT...

XM_057939386.1
CAATTTGAATTGGTGGTGCATCGATTAAATGCAAATTGCAGCGTATTAAATTGATAAGCAGCTTAAAAAAGGTGAAAGCCATAAATACGGCATTACCTGCTTTCCCTCTGCAAGAAAGCAAACCACATCTCATCTCAATCTTAATATATGCAGCACACCACCACCTACCCCGCCGGAATCCGCCGGAAAATCGTAATCCGGTGGAGGTTAATAGAGAAGGCGGCCCTATTCCGGCAGTTCTTCAGAAGAATTCTTGTGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011611
ATGCAGCACACCACCACCTACCCCGCCGGAATCCGCCGGAAAATCGTAATCCGGTGGAGGTTAATAGAGAAGGCGGCCCTATTCCGGCAGTTCTTCAGAAGAATTCTTGTGTGTTCGCTAAGGATGCCTAATCCCCGCTACAGAAGACTCACTTCTCCGCCGTCATCGGAGTCCGCCGGCGGAAGCCAAGAAGACGCCGCCGCGACGTCGTCCAGTAGCTGTTGTGAGAGCGACTCCGATTTGGTCTCGTTGAAGATCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795368.1
MQHTTTYPAGIRRKIVIRWRLIEKAALFRQFFRRILVCSLRMPNPRYRRLTSPPSSESAGGSQEDAAATSSSSCCESDSDLVSLKITMLGDPQIGKTTFLVKYVGDEEEKRSLQMKGVNVMDKTMCIHGARIALTIWDVGGEKRSFDQVPIACKNAVAILFMFDLTSRRTLNSIIGWYSEARKWNKTAVPIVIGTKFDDFMQLPPDIQWTVVTQARRYAKAMNAAIFFSSAKHNINVNKLFKFIMAKLFNLPWTLHRNLT...

XP_057795369.1
MQHTTTYPAGIRRKIVIRWRLIEKAALFRQFFRRILVCSLRMPNPRYRRLTSPPSSESAGGSQEDAAATSSSSCCESDSDLVSLKITMLGDPQIGKTTFLVKYVGDEEEKRSLQMKGVNVMDKTMCIHGARIALTIWDVGGEKRSFDQVPIACKNAVAILFMFDLTSRRTLNSIIGWYSEARKWNKTAVPIVIGTKFDDFMQLPPDIQWTVVTQVLVCSKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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