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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001236`

染色体: Chr02 坐标: 22717250-22725254 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001236`
名称	SmilChr02G001236
描述	FHA domain-containing protein DDL-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22717250 - 22725254 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011610`
GeneID	`131011610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011610`
原始查询	`SmilChr02G001236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FHA domain-containing protein DDL-like
产物	FHA domain-containing protein DDL-like
Arabidopsis	`AT3G20550` (DDL) SMAD/FHA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821601] identity=57; qcov=0.785; evalue=9.84e-102; confidence=high
Rice	`Os05g0545600` - identity=76.8; qcov=0.453; evalue=3.98e-100; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00498 (FHA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795364.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.80000	`XP_057795364.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057795364.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057795364.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795364.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22719049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr2:22724118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C74
`Chr2:22724440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795364.1

400 aa

200

400

FHA

PF00498 FHA 305-385 aa

XP_057795365.1

400 aa

200

400

FHA

PF00498 FHA 305-385 aa

XP_057795366.1

400 aa

200

400

FHA

PF00498 FHA 305-385 aa

XP_057795367.1

400 aa

200

400

FHA

PF00498 FHA 305-385 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795364.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	305	385	3.9e-17	63.1	FHA domain
`XP_057795365.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	305	385	3.9e-17	63.1	FHA domain
`XP_057795366.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	305	385	3.9e-17	63.1	FHA domain
`XP_057795367.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	305	385	3.9e-17	63.1	FHA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939382.1
ATACGGAGGGAGTATGTATTAACCATACAACACTATCTCACGAAAAAACCTAAAACTCTTTCAGACCCTAACTGCCGCGGCGCCGCTACCCACCCCACACGCCGGCTGCCTCCATTCTATCCTCCGGCACGGCCGCCATCCTGCCACGGCGCCGCCTCCCTTCTCCCTTCCCCTTCGGCTCAGCCTTCTCTCAACTCCAACGCCACAGCGCGCGGCCTCTCCTCCACAGAGTGCCGCTTCCACCTTCGGCATTCGCCACC...

XM_057939384.1
AACCATACAACACTATCTCACGAAAAAACCTAAAACTCTTTCAGACCCTAACTGCCGCGGCGCCGCTACCCACCCCACACGCCGGCTGCCTCCATTCTATCCTCCGGCACGGCCGCCATCCTGCCACGGCGCCGCCTCCCTTCTCCCTTCCCCTTCGGCTCAGCCTTCTCTCAACTCCAACGCCACAGCGCGCGGCCTCTCCTCCACAGAGTGCCGCTTCCACCTTCGGCATTCGCCACCAGCAGCAGTGTCCCCTCCTC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131011610
ATGGGGCGCCGCAACTCTGTATCTCCTGTCAGAACTGATAGGTCTCCTCGTAGAAGAAGCCCCTCTCGTAGAGAAAGATCTCCTGCTCATGAAAAAAGAAAGTCTCCTCCCAATCACAGGAGTTCAAATGCAGATAGGCTTTCAAGTCGTACTAGATCACCTAAACGAGCTAGATCAAGATCCCCTGCATCTCATTCACCTGTGAGGGAGAAAATCCATAGCCGCACCAAACCCCCAAACCCTAGAAAATCACCATCTCG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057795364.1
MGRRNSVSPVRTDRSPRRRSPSRRERSPAHEKRKSPPNHRSSNADRLSSRTRSPKRARSRSPASHSPVREKIHSRTKPPNPRKSPSRSPIHVRQKLSSRTRSPNREKSRSPPPLSPRSKRLQRTKSERDADKGSEREYEKNHNRKSDRAAREEKELGRDLPVEKKERKLGRDAAGNGSRSRHERSCSPSDRHRRGQRRSRSPSTADNRGRNELANPRDDEDRNGDSEALAKMRAVEESLEAKEKHKPSFELSGKLAAETN...

XP_057795365.1
MGRRNSVSPVRTDRSPRRRSPSRRERSPAHEKRKSPPNHRSSNADRLSSRTRSPKRARSRSPASHSPVREKIHSRTKPPNPRKSPSRSPIHVRQKLSSRTRSPNREKSRSPPPLSPRSKRLQRTKSERDADKGSEREYEKNHNRKSDRAAREEKELGRDLPVEKKERKLGRDAAGNGSRSRHERSCSPSDRHRRGQRRSRSPSTADNRGRNELANPRDDEDRNGDSEALAKMRAVEESLEAKEKHKPSFELSGKLAAETN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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