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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001238`

染色体: Chr02 坐标: 22750330-22751232 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001238`
名称	SmilChr02G001238
描述	uncharacterized SmilChr02G001238
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22750330 - 22751232 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008144`
GeneID	`131008144`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008144`
原始查询	`SmilChr02G001238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=32.3; qcov=0.857; evalue=1.38e-33; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=30.1; qcov=0.973; evalue=2.1e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008144

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791021.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791021.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791021.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791021.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22750356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:22750377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr2:22750427`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A16,B95,B96,C44,C50,C62,C67,C81
`Chr2:22750440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B26,B42
`Chr2:22750459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr2:22750464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B54,C36,C64
`Chr2:22750466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:22750474`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	22	A18,A21,A5,B106,B140,B16,B26,B31,B48,B49,B52,B66,B70,B9,B95,C10,C14,C40,C50,C54,C70,C77
`Chr2:22750495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:22750504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:22750505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C55
`Chr2:22750507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B31,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935038.1
ATGTTTAAACTTAAGAGACTCAAGTTGGCTCTTAAAGGCTGGAATAAGCAAGTGTTTGGTAATGTGGATGAGGGCATTCGGAGTTTACAATCTTCCCTGGAAGAGATTCAGCTTGAGATTGCGCAAGAGGGATACTCTGATTCCCTTTTTGATGCAGAGGTTGCAGCTCAAGCTCGGCTGGGGTCCATTTTGAATCAGAAAAACTCTCTTTTGCGGCAAAAAAGTCGGGTCAGATGGCTTAATGATGGTGATAAAAATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008144
ATGTTTAAACTTAAGAGACTCAAGTTGGCTCTTAAAGGCTGGAATAAGCAAGTGTTTGGTAATGTGGATGAGGGCATTCGGAGTTTACAATCTTCCCTGGAAGAGATTCAGCTTGAGATTGCGCAAGAGGGATACTCTGATTCCCTTTTTGATGCAGAGGTTGCAGCTCAAGCTCGGCTGGGGTCCATTTTGAATCAGAAAAACTCTCTTTTGCGGCAAAAAAGTCGGGTCAGATGGCTTAATGATGGTGATAAAAATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791021.1
MFKLKRLKLALKGWNKQVFGNVDEGIRSLQSSLEEIQLEIAQEGYSDSLFDAEVAAQARLGSILNQKNSLLRQKSRVRWLNDGDKNTSFFHKRFKMRRKHLFLPQLKIDGVDVFDQEAIAHHIVGYFSSLFSETRAPEVTIQDLHPILTKKISQQQNIFLISIPTEEEIKAAVFDLAGDSAAGPDGFSGSFFQHCWTTIQKDVLKAVSTFFLKNYLPAGLNSNTLILIPKKEVVNSVADLRPIILSNFFFKILSKILASR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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