当前解析结果
SmilChr02G001239| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001239 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001239 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001239 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 22779036 - 22780009 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008145 |
|---|---|
| GeneID | 131008145 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008145 |
| 原始查询 | SmilChr02G001239 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008145 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791022.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057791022.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057791022.1 |
| 4 | Nucleolar fibrillar center | Nucleolar fibrillar center | 0.20000 | XP_057791022.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791022.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:22779058 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B111,B12,B59,B77,C9 |
Chr2:22779060 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,C60 |
Chr2:22779075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | A23,B18,B37,B87,C29,C30,C37,C53,C57 |
Chr2:22779078 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B118,B60,C25,C63 |
Chr2:22779089 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B45,C57 |
Chr2:22779096 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C82,C83 |
Chr2:22779102 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B29,B41,B43 |
Chr2:22779108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B96,D4 |
Chr2:22779109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B29,B41,B43 |
Chr2:22779112 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C16 |
Chr2:22779118 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B10,C10,C62,C64 |
Chr2:22779128 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。