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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001240`

染色体: Chr02 坐标: 22785038-22786825 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001240`
名称	SmilChr02G001240
描述	uncharacterized SmilChr02G001240
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22785038 - 22786825 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011612`
GeneID	`131011612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011612`
原始查询	`SmilChr02G001240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G04420` (AT2G04420) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814982] identity=25.9; qcov=0.608; evalue=7.29e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0630250` - identity=31.2; qcov=0.542; evalue=3.48e-09; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795370.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057795370.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057795370.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795370.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795370.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22785513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B55,B68,C57
`Chr2:22785529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B1,B109,B55,B60,B68,C28,C48,C57,D6
`Chr2:22785535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B109,B68,C62
`Chr2:22785538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A16,A22,B106,B127,B135,B136,B21,B23,B37,B41,B55,B6,B80,C30,C40,C63,C87
`Chr2:22785600`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A16,A20,B105,B11,B121,B123,B128,B130,B133,B136,B15,B17,B22,B24,B29,B31,B36,B39,B46,B47,B49,B51,B52,B57,B6,B60,B69,B79,B85,B87,B88,B89,B97,C11,C14,C18,C19,C23,C24,C25,C29,C3,C33,C39,C42,C49,C50,C51,C57,C58,C65,C67,C69,C77,C79,C8,C80,C84
`Chr2:22785606`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	B1,B109,B120,B135,B37,B55,B61,B68,C24,C28,C30,C57,C63,D6
`Chr2:22785609`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	B1,B109,B120,B135,B37,B55,B61,B68,C24,C28,C30,C57,C63,D6
`Chr2:22785616`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	B1,B109,B120,B135,B37,B55,B61,B68,C24,C28,C30,C48,C57,C63,D6
`Chr2:22785621`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B120,B135,B37,B55,B61,C24,C28,C30,C48,C57,C63,D6
`Chr2:22785664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A5,B137,B42,B43,C50,D4
`Chr2:22785678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A2,B101,B108,B112,B117,B12,B122,B13,B16,B28,B65,B72,B89,B94,C16,C46,C5,C61
`Chr2:22785686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795370.1

260 aa

130

260

RVT_3

PF13456 RVT_3 109-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795370.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	109	228	1e-12	48.8	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939387.1
CACTTTCTATTCTTTTCTGGATTGACAACTGGCTTGGTTATAGGCTCATTGACAGGATTGAGATTCCCAGCGCTGTCCATCCGCATCTTCAGCAGCCGATCGATCTCTAATTATTTTTATGATAGTTCCTGGTATTTCACTTTGGATTTTCTGGTGGCTTTTCCTGAGATTACTTTTGACATTAATTGTTTCGACCCCTATCTTTGGGGTCGATGATCGTCGTGCTTGGACTCATTCTCACTTTGGAGAGGTTACTTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011612
ATGTTCATCTTTTTTGGGAGTGTTCGATTGCCAAGCAGGCAAGTCGCGAACCTTTGGCCGGTCGGTGTCATGTCCATTGTTTGGGGTATTTGGAACCATCGGAATAAGGCGGTGTTTGATGATGCTTCTATTTCTGCCACCACTTTGGCTGTCCAGGTCAAGGCTTTCATTCTTGAGGCTTCTCGTTTCAATCTTGGCGAGATGACTAACTCGGTTGAGGAGTTGCCGGTTCTTCATGGTCTTGGGGTGCCGGGCAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795370.1
MFIFFGSVRLPSRQVANLWPVGVMSIVWGIWNHRNKAVFDDASISATTLAVQVKAFILEASRFNLGEMTNSVEELPVLHGLGVPGKPCRPTSYVYVFWLPPPYPWRKINIDGSVHGSPLCIHAGDIIRDSSTVIGCFHFAAGRDWAFKAELLALIIALEQVVVQGWDYIWIEIDYTYLVDLFCSCSYSVPWRFFSRWWKILQDITDLHIIITHIYREENHVADFLASSVVDEGYWPFAISYILQLVRDDNRSLPYVRIVQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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