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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001244`

染色体: Chr02 坐标: 22832463-22836275 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001244`
名称	SmilChr02G001244
描述	tryptophan synthase beta chain 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22832463 - 22836275 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011616`
GeneID	`131011616`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011616`
原始查询	`SmilChr02G001244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tryptophan synthase beta chain 1-like
产物	tryptophan synthase beta chain 1-like
Arabidopsis	`AT4G27070` (TSB2) tryptophan synthase beta-subunit 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828815] identity=79.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0135900` (TS) - identity=85.3; qcov=0.876; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000162 (L-tryptophan biosynthetic process); GO:0004834 (tryptophan synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009570 (chloroplast stroma)
KEGG	smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00291 (PALP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011616

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795371.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057795371.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795371.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795371.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22832714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B71,C62
`Chr2:22832746`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C58,C78
`Chr2:22832746`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C58,C78
`Chr2:22832813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B9,C58,C86
`Chr2:22832815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B9,C58,C86
`Chr2:22832818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B9,C86
`Chr2:22832821`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B58,B9,C86
`Chr2:22832821`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B58,B9,C86
`Chr2:22832832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B58,B9,C86
`Chr2:22832836`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B58,B9,C58,C86
`Chr2:22832836`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B58,B9,C58,C86
`Chr2:22832838`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B58,B9,C58,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795371.1

466 aa

233

466

PALP

PF00291 PALP 123-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795371.1`	Pfam	`PF00291`	PALP	Family	123	451	2e-46	159.4	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939388.1
TCATTTACTGAATGCGCCACAGTTGCGTAAAGTCGAAGATATTTTAAATATTTTTTCCCCTATTTTAGAAGTGGGCACGTTTTTGTAGGACAAAGCAAAACGAAAGCAGTGCGTCTGAGAGCAGATTCTTACAAATAAACAGCAATCCATCATCTGCCGTGTTTGGCTAAAGGCGTCATTCTCATCCCGACTCCACACATTTCCCAATTTGGTTATATCAAGTGGTCGCAATCCAAACATGGCATTGGCTGCTTCTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011616
ATGGCATTGGCTGCTTCTTCATCCTCTGCCGCCACAGCTCGCAGCACCAGCGCCCAACCCGACCTCGCCTTCCGCATCCCTTCCAATCCGCTCAAATTCACCCCTTTCATTTCCCGCCGCACCCCCTCAATCTCCTGCAAGCTCCCCAAGATGGCGGCTACGGCGGTGGACAAGGAGCTCGACGCCGCCGCTAAGGAGGCGCTGCAGCGGCCTGATGCCTTCGGCCGATTCGGCAGATTTGGCGGGAAGTATGTCCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795371.1
MALAASSSSAATARSTSAQPDLAFRIPSNPLKFTPFISRRTPSISCKLPKMAATAVDKELDAAAKEALQRPDAFGRFGRFGGKYVPETLMAALTELEAAFNSLATDHEFQKELDGILKDYVGRESPLYFAERLTEHYKRHDGKGPHVYLKREDLNHTGAHKINNAVAQALLAKRLGKKRIIAETGAGQHGVATATVCARFGLECIIYMGAQDMERQALNVFRMRLLGAEVRPVHSGTATLKDATSEAIRDWVTNVESTHY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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