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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001250`

染色体: Chr02 坐标: 22985814-22986902 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001250`
名称	SmilChr02G001250
描述	early nodulin-like protein 9
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22985814 - 22986902 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011623`
GeneID	`131011623`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011623`
原始查询	`SmilChr02G001250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	early nodulin-like protein 9
产物	early nodulin-like protein 9
Arabidopsis	`AT3G20570` (ENODL9) early nodulin-like protein 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821604] identity=50.3; qcov=0.868; evalue=5.37e-52; confidence=high
Rice	`Os02g0162200` (OsENODL6) - identity=50; qcov=0.588; evalue=2.37e-36; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011623

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057795380.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795380.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795380.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795380.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22986218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B95,C81
`Chr2:22986227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:22986274`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	110	A14,A20,A24,A25,A4,A9,B103,B105,B109,B110,B115,B118,B119,B12,B120,B123,B127,B128,B129,B131,B135,B137,B139,B14,B140,B15,B21,B22,B23,B27,B30,B33,B35,B36,B38,B39,B4,B42,B43,B46,B47,B48,B5,B50,B52,B53,B55,B56,B58,B59,B61,B62,B68,B70,B72,B73,B76,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B88,B90,B92,B93,B95,B96,B97,C12,C13,C17,C19,C21,C23,C29,C31,C34,C36,C38,C39,C44,C45,C47,C49,C52,C53,C54,C55,C56,C59,C60,C63,C64,C66,C7,C70,C72,C73,C74,C8,C81,C84,C86,D1,D11,D2,D6,D7
`Chr2:22986276`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	158	A16,A18,A20,A21,A22,A24,A25,A5,A9,B104,B105,B106,B109,B110,B113,B115,B118,B119,B121,B123,B125,B126,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B14,B15,B17,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B68,B69,B70,B71,B72,B75,B76,B79,B8,B80,B82,B83,B85,B88,B9,B93,B94,B95,B97,B98,C11,C12,C14,C18,C19,C21,C22,C23,C24,C26,C29,C3,C30,C33,C34,C36,C37,C39,C40,C41,C42,C44,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C58,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C71,C73,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D4,D5,D8
`Chr2:22986371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B53,B71,C20
`Chr2:22986628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B14
`Chr2:22986654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B113
`Chr2:22986654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:22986724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795380.1

204 aa

102

204

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 35-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795380.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	35	117	1.6e-24	86.4	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939397.1
CAAGAAATCCAAAGAGGAATAACAAAAAGAAGCCAAAACTTCACTCCCACACCTCCCCAAAAGTTGGTCCAATCCCATCTACATAAACCTCCTTCCCAATCATTCAACATTACCCTCAACCAAATCTCCTAGCTAGCTCCTCCTTCTCTACAATGGCATCCACGAATCAACGTGTCCTCAGCCTTCTGAGCGTGCTGCTTCTGATACTGCAGAGATGCCATGCCTTTGAATTCAAAGTGGGAGGATCGCAAGGTTGGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011623
ATGGCATCCACGAATCAACGTGTCCTCAGCCTTCTGAGCGTGCTGCTTCTGATACTGCAGAGATGCCATGCCTTTGAATTCAAAGTGGGAGGATCGCAAGGTTGGGCAGTTCCCACCGACGCCGCCCTCTTCAACCACTGGGCTGAAAAAGCCCGATTCCAGATTGGCGATTCCTTGCTTTTCGTATATTCCTCGGATCACGACTCGGTTCTGCACGTGAGCAAGGAGGACTACGCGAGCTGCAGCGCCGACAAACCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795380.1
MASTNQRVLSLLSVLLLILQRCHAFEFKVGGSQGWAVPTDAALFNHWAEKARFQIGDSLLFVYSSDHDSVLHVSKEDYASCSADKPLDKFTDGHTVYKLDQSGPHYFISGVAENCHKNEKLIVVVMADRSNKTAAAPSPSEGMSPPSPAPAGEESPPPPPAEETNPTPAPSEESSPAKNAASSVASAVVGTVAVLFGSSFALAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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