当前解析结果
SmilChr02G001263| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001263 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001263 |
| 描述 | protein NDR1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 23136899 - 23137839 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011631 |
|---|---|
| GeneID | 131011631 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011631 |
| 原始查询 | SmilChr02G001263 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein NDR1-like |
| 产物 | protein NDR1-like |
| Arabidopsis | AT3G20600 (NDR1)Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821607] identity=43.1; qcov=0.959; evalue=1.77e-41; confidence=medium |
| Rice | Os07g0531500 (P0681F05.132)- identity=27.3; qcov=0.878; evalue=2.01e-15; confidence=low |
| GO | GO:0098542 (defense response to other organism) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011631 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057795385.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057795385.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795385.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795385.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795385.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:23137145 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr2:23137238 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B125,B94,C58,C82,C86 |
Chr2:23137566 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B50,C10,C54,C81 |
Chr2:23137571 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,C5,C64,C66,D11 |
Chr2:23137666 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B37,B82,C12 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。