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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001268`

染色体: Chr02 坐标: 23234032-23246140 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001268`
名称	SmilChr02G001268
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	23234032 - 23246140 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008362`
GeneID	`131008362`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008362`
原始查询	`SmilChr02G001268`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790, mitochondrial-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G04790` (AT4G04790) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825816] identity=44.5; qcov=0.778; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os02g0132600` - identity=46.6; qcov=0.543; evalue=5.02e-153; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR); PF13041 (PPR_2); PF13812 (PPR_3); PF17177 (PPR_long)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008362

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057791230.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791230.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791230.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791230.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:23234216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91
`Chr2:23234233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:23234234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C30,C54
`Chr2:23234249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C30,C54
`Chr2:23234285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr2:23234321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:23234664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:23235090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr2:23235209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:23236417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:23237984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:23237998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791230.1

913 aa

456

913

PPR_long

PPR_2

PPR

PPR_3

PPR

PF17177 PPR_long 471-605 aa PF13041 PPR_2 562-605 aa PF01535 PPR 565-594 aa PF13812 PPR_3 565-605 aa PF01535 PPR 669-694 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791230.1`	Pfam	`PF17177`	PPR_long	Repeat	471	605	1.1e-19	71.4	Pentacotripeptide-repeat region of PRORP
`XP_057791230.1`	Pfam	`PF13041`	PPR_2	Repeat	562	605	1.6e-23	83.2	PPR repeat family
`XP_057791230.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	565	594	7.1e-16	58.0	PPR repeat
`XP_057791230.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	565	605	9.8e-19	67.9	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057791230.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	669	694	7.1e-16	58.0	PPR repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935247.1
AAGAATCTGAAAAAGAGAGGGAAGAAATAGGAAACCCATCTCTCTCACTAGAGAGTCACAGGCATGTTCTTCCGGCCTGAACTCCAAAATCATCTCTCATTCTTTCATTGACAATGCATGGCACTTTTCGAAGGAGTTCATCTACGCCCCAAAACCTAGTCTCTCTCTTCTTCTCCGCCGCTAGGTTAACATTTAGGCGCACCAAAACCTCCGCCGCCAGGAAGAAACGGAACATCTCGGGACACTCATCGTCCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008362
ATGCATGGCACTTTTCGAAGGAGTTCATCTACGCCCCAAAACCTAGTCTCTCTCTTCTTCTCCGCCGCTAGGTTAACATTTAGGCGCACCAAAACCTCCGCCGCCAGGAAGAAACGGAACATCTCGGGACACTCATCGTCCGCCGCCAAGAAGAAGACGTCCTCCTCCTCCTCCGACGTTCTCTTGAAAGGCTACATCTCATCCGTCAAACCCTCCCCTCCCGCGCCCTACGACAAAACCAAACGTGAAAGAAGCCGACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791230.1
MHGTFRRSSSTPQNLVSLFFSAARLTFRRTKTSAARKKRNISGHSSSAAKKKTSSSSSDVLLKGYISSVKPSPPAPYDKTKRERSRRLLQTFKAPQSSIVPNPPSSSIVPNPPNSSLGSIVCGSLTSDCIDEDDESAEQLASDASSILYDEMDLNWDDGYQEHLQIKNATLVPWLDKMAHNSISLWRKEFSQDKKQKWVFKEGQYPRYKRLVKMCAMKLGSDTTVELFGKLGRENGLEEFNMLIKICIKKARETTDEDVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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