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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001275`

染色体: Chr02 坐标: 23396785-23397816 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001275`
名称	SmilChr02G001275
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	23396785 - 23397816 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008157`
GeneID	`131008157`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008157`
原始查询	`SmilChr02G001275`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
产物	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT4G15090` (FAR1) FRS (FAR1 Related Sequences) transcription factor family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827173] identity=32.4; qcov=0.819; evalue=3.35e-45; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=41.1; qcov=0.752; evalue=5.02e-63; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008157

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791034.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791034.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791034.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791034.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:23396826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr2:23396869`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A19,A22,A4,A5,B115,B12,B126,B16,B17,B18,B20,B23,B30,B36,B4,B48,B56,B58,B62,B65,B67,B7,B70,B84,B88,B96,B99,C16,C22,C24,C27,C3,C33,C34,C44,C53,C56,C59,C64,C66,C70,C76,D1,D2,D6,D7
`Chr2:23396883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D11
`Chr2:23396929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:23396987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	45	A13,A20,A22,A5,B1,B102,B105,B115,B125,B128,B136,B137,B139,B17,B20,B24,B29,B39,B49,B50,B53,B57,B58,B59,B61,B70,B72,B8,B81,B92,B97,C14,C15,C19,C23,C33,C47,C50,C55,C57,C58,C67,C7,C73,C84
`Chr2:23396994`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr2:23396994`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr2:23397003`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B35,B43,B52,B77,C36,C49,C80,D5
`Chr2:23397019`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr2:23397019`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B92
`Chr2:23397088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:23397089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B41,B64,C20,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791034.1

343 aa

172

343

MULE

PF10551 MULE 285-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791034.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	285	340	1.8e-13	51.4	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935051.1
ATGGAAGAGCTAGATGCAGTAAGAAGAGCTAAGATGCATGAGCTTTTTGGCGAAGATGTAGAAGACTCGGACGAAATTTCAGATCAAAATGGAGAAGAGCTTTTCGGTGAAGATGGAGTAGATTCACACGAGGTTTTAGATCAAGATGAAGAAGAGCAACATGAGAACACGGAGGAGGACGAAGATTTATTTGGAGTTGATTGGCTGGCATGTGAGAAGATGATGCAGAATGGTCTGCAATCTGGTTTGGAATTTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008157
ATGGAAGAGCTAGATGCAGTAAGAAGAGCTAAGATGCATGAGCTTTTTGGCGAAGATGTAGAAGACTCGGACGAAATTTCAGATCAAAATGGAGAAGAGCTTTTCGGTGAAGATGGAGTAGATTCACACGAGGTTTTAGATCAAGATGAAGAAGAGCAACATGAGAACACGGAGGAGGACGAAGATTTATTTGGAGTTGATTGGCTGGCATGTGAGAAGATGATGCAGAATGGTCTGCAATCTGGTTTGGAATTTGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791034.1
MEELDAVRRAKMHELFGEDVEDSDEISDQNGEELFGEDGVDSHEVLDQDEEEQHENTEEDEDLFGVDWLACEKMMQNGLQSGLEFENRDSLFTAYQAFAKVAGFNVSTRNKRDRYLMISCERARKTNAKYTKKMNCPARLNAIKQDNDKWKVSTVCNEHNHELEPHMSEFMPAHRHLSTNLKVHLDAYDRAGLRLCKSVRMMEVLVGGPPNLGASMKDCRNYVDKMRKLRLGDGDAAAIQQLFKRLQQNDKDFFYLLDID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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