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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001279`

染色体: Chr02 坐标: 23485375-23485845 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001279`
名称	SmilChr02G001279
描述	uncharacterized SmilChr02G001279
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	23485375 - 23485845 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008161`
GeneID	`131008161`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008161`
原始查询	`SmilChr02G001279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.7; qcov=0.564; evalue=2.55e-22; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=59; qcov=1; evalue=1.24e-64; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008161

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791038.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791038.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791038.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791038.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:23485391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C45
`Chr2:23485407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr2:23485411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B134,B53,C1,C12,C25,C79
`Chr2:23485432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B105,B129,B81
`Chr2:23485448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:23485474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B129,B136,B81,C81
`Chr2:23485533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,A8
`Chr2:23485552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C46
`Chr2:23485560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:23485562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B134,B87,C1,C25,C77,C79
`Chr2:23485564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B129,B81
`Chr2:23485568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791038.1

156 aa

156

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 1-155 aa PF13359 DDE_Tnp_4 25-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791038.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	1	155	4.2e-69	233.0	Plant transposon protein
`XP_057791038.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	25	151	2.9e-06	27.7	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935055.1
ATGCATTGGGGATGGAAGAATTGCCCCGTGGCTTGGCACGGCGCCTACACTCGAGGGGATCAAGGCGAGCCAACAATTATATTAGAGGTCGTTGCTTCACAAGATTTGTGGATCTGGCATGCATTCTTTGGAGTCGCTGGGTCCAACAACGACATCAACGTGCTCCACCAGTCCACGCTATTCAACGATGTTTTAGCGGGGCATGAAGCGGCTGTGCACTTCCTCGCCAACAATTCTCACCACACTCGAGGATACTACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008161
ATGCATTGGGGATGGAAGAATTGCCCCGTGGCTTGGCACGGCGCCTACACTCGAGGGGATCAAGGCGAGCCAACAATTATATTAGAGGTCGTTGCTTCACAAGATTTGTGGATCTGGCATGCATTCTTTGGAGTCGCTGGGTCCAACAACGACATCAACGTGCTCCACCAGTCCACGCTATTCAACGATGTTTTAGCGGGGCATGAAGCGGCTGTGCACTTCCTCGCCAACAATTCTCACCACACTCGAGGATACTACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791038.1
MHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEVVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEAAVHFLANNSHHTRGYYLTDGIYPDWPVFVKSFQFPNDEKKRRFKVMQEATRKDVERAFGVLQARWGIIRGPSRLWKAEQMSSIMFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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