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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001284`

染色体: Chr02 坐标: 23677852-23679331 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001284`
名称	SmilChr02G001284
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	23677852 - 23679331 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008163`
GeneID	`131008163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008163`
原始查询	`SmilChr02G001284`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=40.9; qcov=0.88; evalue=1.98e-37; confidence=medium
Rice	`Os05g0583100` - identity=41; qcov=0.942; evalue=9.29e-47; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT); PF14372 (hAT-like_RNase-H)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791040.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791040.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791040.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791040.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:23678598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:23678728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,D2
`Chr2:23678745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B36,B58
`Chr2:23678752`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B104,B74
`Chr2:23678752`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B104,B74
`Chr2:23678790`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	94	A10,A11,A14,A19,A20,A23,A25,A3,A5,A8,B10,B102,B104,B109,B11,B114,B117,B119,B120,B121,B126,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B17,B21,B25,B28,B29,B3,B32,B33,B38,B4,B41,B42,B51,B52,B53,B54,B57,B60,B62,B63,B65,B66,B68,B72,B73,B74,B76,B79,B80,B82,B85,B95,B96,C11,C18,C20,C24,C28,C3,C38,C4,C41,C45,C46,C49,C5,C53,C56,C60,C61,C69,C71,C74,C75,C76,C77,C81,C82,C84,C87,D1,D11,D3,D5,D7,D9
`Chr2:23678803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A10,A14,A23,A8,B102,B117,B121,B137,B138,B17,B21,B28,B53,B63,B68,B76,C24,C4,C41,C46,C67,C77,C81,C82
`Chr2:23678804`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B26,C77
`Chr2:23678804`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr2:23678847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B30
`Chr2:23678868`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B101,B96
`Chr2:23678868`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B101,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791040.1

225 aa

112

225

hAT-like_RNase-H

Dimer_Tnp_hAT

PF14372 hAT-like_RNase-H 1-66 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 116-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791040.1`	Pfam	`PF14372`	hAT-like_RNase-H	Domain	1	66	1.4e-24	86.8	hAT-like transposase, RNase-H fold
`XP_057791040.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	116	200	1e-24	86.8	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935057.1
ATGGTTGGAGCTATGAAGACTAAATTTGACAAATATTGGGGAGAGTGCAACTTGTTGATGGCTATTGCTGCTATTTTAGATCCGAGGTGTAAGATGACGGTCATTGAGTATTGTTTTCCCAAAATGTATTCCAAAGAAGAAGCTCGTGAAAAAATCAAGAAAGTCAAGGATGCATTATATGAGTTGTATGATGAATATGTGGCGGACATGTATTCTGATACTTCTACACAAAGTGAGCAAATCATTGACAATACCGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008163
ATGGTTGGAGCTATGAAGACTAAATTTGACAAATATTGGGGAGAGTGCAACTTGTTGATGGCTATTGCTGCTATTTTAGATCCGAGGTGTAAGATGACGGTCATTGAGTATTGTTTTCCCAAAATGTATTCCAAAGAAGAAGCTCGTGAAAAAATCAAGAAAGTCAAGGATGCATTATATGAGTTGTATGATGAATATGTGGCGGACATGTATTCTGATACTTCTACACAAAGTGAGCAAATCATTGACAATACCGATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791040.1
MVGAMKTKFDKYWGECNLLMAIAAILDPRCKMTVIEYCFPKMYSKEEAREKIKKVKDALYELYDEYVADMYSDTSTQSEQIIDNTDRRSGVKVASGWSEFIQHVKSAQTSKPQQSELSNYLEEGCHICEDMSTPFDALEWWRTSALKYRILSKMARDILAIPVSTVASEATFSAGGRVIDAYRASLNADTVQTLICGGDWCRSLHGVKRKNKSEKKPLEIMLPIP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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