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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001285`

染色体: Chr02 坐标: 23679351-23681130 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001285`
名称	SmilChr02G001285
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	23679351 - 23681130 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008164`
GeneID	`131008164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008164`
原始查询	`SmilChr02G001285`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=27.2; qcov=0.867; evalue=5.33e-33; confidence=low
Rice	`Os03g0822100` - identity=31.5; qcov=0.91; evalue=5.42e-55; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791041.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791041.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791041.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791041.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791041.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:23679405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:23679408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C19,C87
`Chr2:23679453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:23679606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B30,B36,B58
`Chr2:23679613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B30,B36,B58
`Chr2:23679654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D2
`Chr2:23679708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:23679758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C15
`Chr2:23679767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A18,A25,B110,B128,B132,B137,B20,B26,B29,B39,B42,B43,B46,B56,B57,B59,B6,B60,B75,B8,B82,B88,B89,B90,B92,C18,C19,C31,C41,C5,C54,C67,C74,C75,C87,D11
`Chr2:23679778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:23679788`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B93,C53,D2
`Chr2:23679788`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B93,C53,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791041.1

398 aa

199

398

ZBED1_RNase-like

ZBED1_RNase-like_helical

PF27041 ZBED1_RNase-like 233-330 aa PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 333-398 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791041.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	233	330	1.5e-31	109.1	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057791041.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	333	398	1.9e-17	64.0	ZBED1 RNase-like helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935058.1
CTCCATCCACCATTCCAGCACGACCTCCATCCACCATTCCAGCACGACCTCCGACTGCCATTTCCCAGCCCACCGCGACAGCAGCAGCGACGCCGCGACGGCTCTGCCCTCCTCGGCGTGACAGTAGCAGCAGTGCAGCAGTTGATAATGGCATTCTCCCCTCCTGAAGTCTCCTCAACAATGCCCAATGCAATAACATCTCAAAACTCCATTGACAATCAACATTCAACGGATGATCATATTGTTACAAATACTGACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008164
ATGGCATTCTCCCCTCCTGAAGTCTCCTCAACAATGCCCAATGCAATAACATCTCAAAACTCCATTGACAATCAACATTCAACGGATGATCATATTGTTACAAATACTGACATTGAAGGTGGAAGTGGAGATGGTGAAACAGGTGGAAGTGCAGATGGTGAAACAGGTGGGAGTGGAGATGGTGATACAGGAGGAGCAGAAGATGATTTGCACTTTCAGCCGAAGAAGAGACAAAAGACTTCGAAAGTTTGGTTGGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791041.1
MAFSPPEVSSTMPNAITSQNSIDNQHSTDDHIVTNTDIEGGSGDGETGGSADGETGGSGDGDTGGAEDDLHFQPKKRQKTSKVWLEFNVIDAVNKAECKHCKSRLSILKSKSTTHLSRHLACCLKRKLNQKQQQKISLEPINENSVSMASIALTDGKFDMRKMREAIAHWILMHEHPFTIVEEEGFNMMQKRAALDWEKVSRNTIKKDCTQVYDIERKKLMAQLKNINKISVTTDLWRSTNQKIEYMVLTGHFVDSCWKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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