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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001301`

染色体: Chr02 坐标: 24135664-24137234 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001301`
名称	SmilChr02G001301
描述	21.7 kDa class VI heat shock protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24135664 - 24137234 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007786`
GeneID	`131007786`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007786`
原始查询	`SmilChr02G001301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	21.7 kDa class VI heat shock protein
产物	21.7 kDa class VI heat shock protein
Arabidopsis	`AT5G54660` (AT5G54660) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835555] identity=47.5; qcov=1.1; evalue=6.39e-49; confidence=medium
Rice	`Os05g0500500` (HSP22.3) - identity=43.8; qcov=0.83; evalue=4.18e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007786

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790685.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790685.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790685.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790685.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790685.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24135792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B41,B61,C22,C51
`Chr2:24135795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:24136333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B140,B56,C85
`Chr2:24136401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B4,C17
`Chr2:24136403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B140,B2,B56,C85
`Chr2:24136404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr2:24136424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:24136488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,C82,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790685.1

173 aa

173

HSP20

PF00011 HSP20 77-168 aa

XP_057790686.1

165 aa

165

HSP20

PF00011 HSP20 91-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790685.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	77	168	1.1e-09	39.0	Hsp20/alpha crystallin family
`XP_057790686.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	91	160	7.6e-07	29.9	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934702.1
AGCCAACTGCAAACCATATCAATTCCATATATCTTTTCTTTTTTCTCGATTCACTGCTTTTTTATTTTCCACAAAACTATCATCACATTTTTGCTTGCTTTATGTTTCGAATAATTCTTCTCTGTGCCTGCCAGCAAGGATAAGAAGATGCCCTTTCCTATTTGCTCACAAATTTTGACCTTCTTAATTGAAGTTGATCCCACCAATTACTTCTCCAGGAACTATTTAAAAAGAAAAGAAATGTATTTTTATTTCATACG...

XM_057934703.1
GATCCCACCAATTACTTCTCCAGGAACTATTTAAAAAGAAAAGAAATGTATTTTTATTTCATACGTTCAATATTCTCTCAATGATTCTTTCAATTTTAACTACTTCTCGCTTCTACTATGTATTATCGACTTTTTAATTCTAATTTCCCTAAACTATTTTCCGCGGTGATAGTATATAAATTTAGTTTCTGCAAATAAAAATAAAATGAATCAAGGATCTAAAAATACATTTATCCTATAATTTCTGACATCCATCAATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007786
ATGAGTAGCAAGCAAATCGAGATCCAATTCGACGACGCAACCCCGCAGAAATGGTGCCAGCCTCTGAAAGAAGATGTGTTCGCAGCCCTAACCAGCAAGCCGATGCACAGATTGGGATCGGTCTTCAGCCCTTTGTTGTTCGGGAAATTCTTCGATCCGTCAGATGCCTTCCCTCTCTGGGAGTTTCAATCGGATGAGGTGCTGCCCAATTCCGCCCACCGCAGCGTCGATTGGTGCCAAACTGATACTGATTTTCTTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790685.1
MSSKQIEIQFDDATPQKWCQPLKEDVFAALTSKPMHRLGSVFSPLLFGKFFDPSDAFPLWEFQSDEVLPNSAHRSVDWCQTDTDFLLKADLSGNSSVQVSVENGKIMEISGQQKESKKRNWKSSQWWEHGYVRRIELPEHADWRKSEAYIKNDSLLEIRIPKLPTNSDAPQEN

XP_057790686.1
MSSKQIEIQFDDATPQKWCQPLKEDVFAALTSKPMHRLGSVFSPLLFGKFFDPSDAFPLWEFQSDEVLPNSAHRSVDWCQTDTDFLLKADLSVENGKIMEISGQQKESKKRNWKSSQWWEHGYVRRIELPEHADWRKSEAYIKNDSLLEIRIPKLPTNSDAPQEN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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