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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001305`

染色体: Chr02 坐标: 24233542-24236968 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001305`
名称	SmilChr02G001305
描述	uncharacterized SmilChr02G001305
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24233542 - 24236968 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007788`
GeneID	`131007788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007788`
原始查询	`SmilChr02G001305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LYR family of Fe/S cluster biosis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843938]; symbol=EMB1793; hit=AT1G76060; species=arabidopsis; confidence=high
产物	LYR family of Fe/S cluster biosis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843938]; symbol=EMB1793; hit=AT1G76060; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G76060` (EMB1793) LYR family of Fe/S cluster biosis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843938] identity=73.6; qcov=0.812; evalue=9.08e-63; confidence=high
Rice	`Os03g0136600` - identity=59; qcov=0.825; evalue=3.76e-49; confidence=medium
GO	GO:0034551 (mitochondrial respiratory chain complex III assembly)
KEGG	-
Pfam	PF05347 (Complex1_LYR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790688.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057790688.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790688.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790688.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24233667`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A10,A21,A5,B105,B12,B21,B24,B47,B59,B6,B83,C13,C26,C50,C59,C61,D3
`Chr2:24233794`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C16
`Chr2:24233794`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C16
`Chr2:24233802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C26
`Chr2:24233818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B59,C38,C75
`Chr2:24233825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B41
`Chr2:24233885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:24234075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790688.1

154 aa

154

Complex1_LYR

PF05347 Complex1_LYR 69-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790688.1`	Pfam	`PF05347`	Complex1_LYR	Family	69	130	2.2e-10	41.1	Complex 1 protein (LYR family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934705.1
ATTCTAACACAAAATCCCTAGAATTTAGAATTGGAGATGTCCAAAGGGGGAAAGGAAAAATAAACGGAAAAAATGTTTCCGAAGATCCAGATTTCGCCGACAATCAGCGCGGTGGCGCGCCACCGCCATGTGGGGCATATCCACCGCCGCTTATTGCACAATGGCCCAGACACCATTGAAGAGCTATTCGACAGGCATGTAGTCAAGAATGATAACAAGCACCTCGATGACGACGAAAAGGAACTTTTGACTCGGCAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007788
ATGTTTCCGAAGATCCAGATTTCGCCGACAATCAGCGCGGTGGCGCGCCACCGCCATGTGGGGCATATCCACCGCCGCTTATTGCACAATGGCCCAGACACCATTGAAGAGCTATTCGACAGGCATGTAGTCAAGAATGATAACAAGCACCTCGATGACGACGAAAAGGAACTTTTGACTCGGCAGCGGCTCACCAGCACTCGTCGCGAGGCTCTGAGTCTGTACCGTGATATCATCCGGGCTACTCGTTTCTTCACGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790688.1
MFPKIQISPTISAVARHRHVGHIHRRLLHNGPDTIEELFDRHVVKNDNKHLDDDEKELLTRQRLTSTRREALSLYRDIIRATRFFTWPDSRGFLWRDVLRENARKEFEAARFEKDPEVVTRLLIGGRDAVQAAIDKLVEKQKHQIDKERNQSGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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