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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001307`

染色体: Chr02 坐标: 24318638-24321474 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001307`
名称	SmilChr02G001307
描述	uncharacterized SmilChr02G001307
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24318638 - 24321474 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007789`
GeneID	`131007789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007789`
原始查询	`SmilChr02G001307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790689.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790689.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790689.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790689.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24318815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B18,C10,C70
`Chr2:24318847`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	78	A1,A13,A18,A19,A4,A6,A7,B101,B103,B104,B108,B109,B11,B113,B121,B124,B125,B128,B131,B135,B14,B17,B18,B19,B22,B3,B32,B37,B4,B42,B43,B45,B57,B6,B62,B64,B69,B72,B76,B77,B81,B82,B85,B9,B91,B92,B94,B97,B99,C12,C14,C15,C16,C19,C23,C26,C29,C30,C36,C39,C44,C5,C53,C56,C58,C59,C60,C62,C66,C67,C69,C74,C78,C83,C87,C9,D1,D3
`Chr2:24318851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr2:24320588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr2:24320605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	B110,B115,B12,B122,B126,B13,B132,B67,C19,C28,C36,C86,D8
`Chr2:24320631`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B99,C43
`Chr2:24320631`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B99,C43
`Chr2:24320632`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B99,C43
`Chr2:24320632`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B99,C43
`Chr2:24320644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B12,C86
`Chr2:24320649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A7,B20,B52,C37,D6
`Chr2:24320649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B20,B52,C37,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790689.1

241 aa

120

241

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 104-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790689.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	104	232	9.7e-13	49.2	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934706.1
CGCAGTGCTGGTCACCGCCGTCACTGTCGTCGTCTTTGCGCGGTGCTGCTCGCCGCTGTGACTCCCTCGCCGCCGCCGTCTCTCTGTCGTCGTCTTCGCGCGGTGCTCGGTCACTCCATCACCCTCCCGCCTTCACCGCAAATCTCCGGTTCAAGCTACCAAATGTCGTCAGATGAACATTTTACGGAGAACAACGATTCAAACAACGATCCCGACAATCCAATTCAAGAGAGTGGGAATGAAAAGGTTGCAGGTGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007789
ATGTCGTCAGATGAACATTTTACGGAGAACAACGATTCAAACAACGATCCCGACAATCCAATTCAAGAGAGTGGGAATGAAAAGGTTGCAGGTGACAATGAAGATCAAAACTCCACTCCAACAGGGAATGCTGCCATTACACAAGCATGGAAAAAATATCACAAGACGGACCGTAATGAGCAGCTTAATCCGGATGTGGAAGGAGTGATACCTGTTGAGGATCTATATGGGCTGTCAAAATACGTCACAAGTGACCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790689.1
MSSDEHFTENNDSNNDPDNPIQESGNEKVAGDNEDQNSTPTGNAAITQAWKKYHKTDRNEQLNPDVEGVIPVEDLYGLSKYVTSDLPGWGKYKPWYDYDELIMVCELESHWVTFSVNFIKSAITIYDSTQRKLDDTDYAVRKTFFTPLARMLPQILKYSGFYDERKEVKPKLTEWRFAYLESGNVYKQTDTKSGGAYALKYAEMILTKQHLPSFEKKDVEKLCVDVAATIYKFSTEGESED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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