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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001312`

染色体: Chr02 坐标: 24346163-24347666 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001312`
名称	SmilChr02G001312
描述	uncharacterized SmilChr02G001312
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24346163 - 24347666 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008171`
GeneID	`131008171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008171`
原始查询	`SmilChr02G001312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=33.7; qcov=0.454; evalue=2.37e-27; confidence=low
Rice	`Os04g0357300` - identity=41.1; qcov=1; evalue=1.68e-76; confidence=medium
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791048.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791048.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791048.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791048.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24346164`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	61	A14,A15,A19,A7,B105,B106,B109,B111,B123,B124,B127,B132,B133,B137,B138,B14,B26,B28,B31,B34,B36,B50,B64,B66,B67,B71,B73,B76,B80,B9,B99,C1,C11,C14,C16,C20,C22,C23,C24,C3,C30,C34,C37,C39,C41,C42,C46,C47,C5,C52,C53,C57,C59,C61,C64,C66,C69,C83,C86,C9,D9
`Chr2:24346230`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C6,C7
`Chr2:24346230`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C6,C7
`Chr2:24346252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B27,B84,C37
`Chr2:24346253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C44
`Chr2:24346273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,D6,D8
`Chr2:24346300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,C29,C56,C61
`Chr2:24346333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B17,C86
`Chr2:24346399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B130,C39
`Chr2:24346411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C12,C86
`Chr2:24346421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr2:24346422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791048.1

359 aa

180

359

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 3-182 aa PF21530 Pif1_2B_dom 290-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791048.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	3	182	5.2e-77	259.1	PIF1-like helicase
`XP_057791048.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	290	336	1.3e-20	73.5	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935065.1
ATGACGGCAGTTGATAAAGGCGAGGTAGGATTTTTCTTTCTATATGGATATGGTGGTACAGGAAAGACATATATTTGGAACACCTTATGCTCGGCCACACGTGGGAGGGGCGATATAGTACTTCCAGTAGCTTCGAGTGGTATAGCATCGTTATTGTTGCCTAGGGGCAGGACTGCACACTCTAGATTCGGTATACCATTGGACTGCCACAAAAACTCCACGTGCAGCAAGATAAACCCAGATAACGATTTAACTGGACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008171
ATGACGGCAGTTGATAAAGGCGAGGTAGGATTTTTCTTTCTATATGGATATGGTGGTACAGGAAAGACATATATTTGGAACACCTTATGCTCGGCCACACGTGGGAGGGGCGATATAGTACTTCCAGTAGCTTCGAGTGGTATAGCATCGTTATTGTTGCCTAGGGGCAGGACTGCACACTCTAGATTCGGTATACCATTGGACTGCCACAAAAACTCCACGTGCAGCAAGATAAACCCAGATAACGATTTAACTGGACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791048.1
MTAVDKGEVGFFFLYGYGGTGKTYIWNTLCSATRGRGDIVLPVASSGIASLLLPRGRTAHSRFGIPLDCHKNSTCSKINPDNDLTGLLVKTKLIIWDEAPMTHRYCFEALDRSLRDIMRSSDRPGKPFGGLLVVLGGDLRQILPVIPKGSRHDIVHASISSSQLWNSCQVLKLTKNMRLQLGYFHEKTTIQRIGKGESVVALSEDILIRNATNPIAAIVENTYNDVMNNAFDPEMFKNRAILAPTNEMVDTINDYVMSLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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