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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001313`

染色体: Chr02 坐标: 24351347-24353477 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001313`
名称	SmilChr02G001313
描述	50S ribosomal protein L24, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24351347 - 24353477 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007792`
GeneID	`131007792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007792`
原始查询	`SmilChr02G001313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L24, chloroplastic
产物	50S ribosomal protein L24%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G54600` (RPL24) Translation protein SH3-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835549] identity=69.2; qcov=0.915; evalue=1.36e-84; confidence=high
Rice	`Os06g0683200` - identity=60.9; qcov=0.979; evalue=8.4e-76; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00467 (KOW); PF17136 (ribosomal_L24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790692.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057790692.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790692.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790692.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24353233`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B115,B64,C65
`Chr2:24353233`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B115,B64,C65
`Chr2:24353279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790692.1

188 aa

188

KOW

ribosomal_L24

PF00467 KOW 69-98 aa PF17136 ribosomal_L24 101-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790692.1`	Pfam	`PF00467`	KOW	Family	69	98	3.3e-08	33.7	KOW motif
`XP_057790692.1`	Pfam	`PF17136`	ribosomal_L24	Domain	101	165	7.9e-21	74.9	Large ribosomal subunit protein uL24, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934709.1
ATCTATAGTTAGAATAGCACACGACTTTAGAAGACTAGTGTTCAACTGTAGAAACCGGGCTTTGGAGCACAGAATAGGAAGCCAATTTTCCAACATTATCTCTCTATCTCTTTCACACAACTCACTGCGCCTAGTGAGAGAAATCCTAGTCCTTCAACAATGGCCGCTCTTCAGAGCTCATTTACGTCGTTAAATCTCGGCACCAGTTCCTTCCTTGGCCAACGCGTCACTCCCTCCCTCCATCTGCCTCTTGTTAAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007792
ATGGCCGCTCTTCAGAGCTCATTTACGTCGTTAAATCTCGGCACCAGTTCCTTCCTTGGCCAACGCGTCACTCCCTCCCTCCATCTGCCTCTTGTTAAGTCAACAGAGCAGCCAAGTTCAATTGTCGCAAAGCTTAAACGATGGGAGCGGAAAGAGTGCAAACCAAACAGTCTACCAGTGCTACATAAAATGCACGTTAAACTTGGAGATACTGTAAAAGTCATTTCCGGAAAGGACAAAGGTAAAGTTGGTGAGGTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790692.1
MAALQSSFTSLNLGTSSFLGQRVTPSLHLPLVKSTEQPSSIVAKLKRWERKECKPNSLPVLHKMHVKLGDTVKVISGKDKGKVGEVSRIITHNSSIVIKDINLKTKHVKSKGEDEPGQIIKIEAPIHSSNVMLYSKEKDVVSRVGHKTLDNGKRVRYLIKTGEIIDSAENWKRVAKEKEKATELAAAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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