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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001325`

染色体: Chr02 坐标: 24734490-24735470 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001325`
名称	SmilChr02G001325
描述	uncharacterized SmilChr02G001325
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24734490 - 24735470 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007805`
GeneID	`131007805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007805`
原始查询	`SmilChr02G001325`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826402]; symbol=AT4G08430; hit=AT4G08430; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826402]; symbol=AT4G08430; hit=AT4G08430; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G08430` (AT4G08430) Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826402] identity=27.7; qcov=0.863; evalue=3.61e-10; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790704.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790704.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790704.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790704.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790704.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24734631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:24734699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B53,B71,C22
`Chr2:24734781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B2,B28
`Chr2:24734817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:24734829`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B11,B73,B89
`Chr2:24734829`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B11,B73,B89
`Chr2:24734863`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A18,A6,B25,B78,C59
`Chr2:24734863`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A18,A6,B25,B78,C59
`Chr2:24734890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B58,C24,C64,C66
`Chr2:24735037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B58,C24,C64,C66
`Chr2:24735240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:24735289`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B125,B126,B34,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790704.1

234 aa

117

234

DUF1985

DUF8566

PF09331 DUF1985 9-147 aa PF29561 DUF8566 18-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790704.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	9	147	4e-20	72.9	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057790704.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	18	158	1.6e-08	35.3	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934721.1
CTAGGTCATGCTTTGGTCATTTTCTTGGATTGCCTAAACCATTAGGAAAATGCATGCAAGTACTTCATTATGTAATTTCACGTCAAATGAAATTTCGTAATGAAGATCCTAGTGAATTGTGGTTTTGTATAAATGGAACTCCCATTCGGTTTAGTCGATTTGAATTTGTGTTGGTGACTGGATTGAGATTTGGCGGTACATCTTTTACTCCATATCGACGACATGCTATGCCTATCGACTCATTCTACACCCGTGTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007805
ATGCAAGTACTTCATTATGTAATTTCACGTCAAATGAAATTTCGTAATGAAGATCCTAGTGAATTGTGGTTTTGTATAAATGGAACTCCCATTCGGTTTAGTCGATTTGAATTTGTGTTGGTGACTGGATTGAGATTTGGCGGTACATCTTTTACTCCATATCGACGACATGCTATGCCTATCGACTCATTCTACACCCGTGTCCTCAATAATAAAAGGATATTGGTTAGTGACTTGCGTGATAGATTTATAGCAAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790704.1
MQVLHYVISRQMKFRNEDPSELWFCINGTPIRFSRFEFVLVTGLRFGGTSFTPYRRHAMPIDSFYTRVLNNKRILVSDLRDRFIAKDLGLLTEDYVKVAKILFVYNVLFGVEKSKPKHISEWLWVLIEDETTWESFPWGSYAFQKLLHFLKSIKKTTSSGTAKRESYTLFGFSTAFMAWIYCAIPEFGSTIGVVSSTTKIPRMLRFRYTRGNIDVADVKDEVYPKLGPNDEERK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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