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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001329`

染色体: Chr02 坐标: 24748839-24751430 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001329`
名称	SmilChr02G001329
描述	uncharacterized SmilChr02G001329
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24748839 - 24751430 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008176`
GeneID	`131008176`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008176`
原始查询	`SmilChr02G001329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.5; qcov=0.781; evalue=6.33e-38; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.9; qcov=0.785; evalue=1.6e-48; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008176

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791053.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791053.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791053.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791053.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791053.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24748853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	173	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A2,A20,A22,A24,A25,A4,A6,A7,A8,A9,B10,B103,B105,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B12,B122,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B31,B33,B34,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C37,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C47,C5,C50,C55,C56,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C69,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C81,C82,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr2:24748925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	180	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A2,A20,A22,A24,A25,A4,A5,A6,A8,A9,B10,B103,B105,B106,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B12,B122,B123,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B27,B28,B29,B3,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C33,C34,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C47,C5,C50,C52,C55,C56,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C81,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D5,D6,D8,D9
`Chr2:24748927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B66,B93
`Chr2:24748938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B24,C85
`Chr2:24748945`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	178	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A2,A20,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B103,B105,B106,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B12,B122,B123,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B27,B28,B29,B3,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C33,C34,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C47,C5,C50,C52,C55,C56,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C81,C82,C84,C86,C87,C9,D1,D2,D5,D6,D8,D9
`Chr2:24748950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,C35,C5,C75
`Chr2:24748999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B65
`Chr2:24749020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:24749021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91
`Chr2:24749022`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A19,B10,B109,B121,B124,B13,B131,B30,B52,B90,B95,C15,C33,C61,C82
`Chr2:24749032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C48
`Chr2:24749053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B19,B47,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791053.1

729 aa

364

729

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 317-428 aa PF10551 MULE 319-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791053.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	317	428	5e-06	26.4	Transposase, Mutator family
`XP_057791053.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	319	425	1.8e-16	61.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935070.1
ATGGTTTACGTCACCATTAGAGAGGAATATTCTTTACCCAATGTAAATGTGAACGTGGCAGGCAGTAGCTCGGCGCCCCTACATGACACAACGCCACATTCTGAATCATATACTCCAGACGAAGAGTCAGATGCTTCAGACGAAGATGAGGAAGCTAATTGTCGTGCTGATTTGCTTCAGAGTATGCAAACTGAAGATAACGCTTGGATGAGTCAGCCACCACAGAAAAACTTCTCGTCTAATGATCAGGCTAATCGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008176
ATGGTTTACGTCACCATTAGAGAGGAATATTCTTTACCCAATGTAAATGTGAACGTGGCAGGCAGTAGCTCGGCGCCCCTACATGACACAACGCCACATTCTGAATCATATACTCCAGACGAAGAGTCAGATGCTTCAGACGAAGATGAGGAAGCTAATTGTCGTGCTGATTTGCTTCAGAGTATGCAAACTGAAGATAACGCTTGGATGAGTCAGCCACCACAGAAAAACTTCTCGTCTAATGATCAGGCTAATCGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791053.1
MVYVTIREEYSLPNVNVNVAGSSSAPLHDTTPHSESYTPDEESDASDEDEEANCRADLLQSMQTEDNAWMSQPPQKNFSSNDQANREDPDGVERIQGNWIISVPELDSVPTLGWEEVLAPDIRSFVKGALFRSKNELIVVVGIYHIENRVEYATQRSSKTRLAFVCKHSEDCSFKMRAKKGESMWRITNLMLDHSCYTDLDRRVARQVTAKVAASYFARRLVAEGCVLRPKEMIDEMLRLHGIKMMYSLALRTRSLAIDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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