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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001340`

染色体: Chr02 坐标: 24936217-24940375 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001340`
名称	SmilChr02G001340
描述	organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24936217 - 24940375 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007816`
GeneID	`131007816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007816`
原始查询	`SmilChr02G001340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial
产物	organelle RRM domain-containing protein 2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G54580` (AT5G54580) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835546] identity=62.2; qcov=1.03; evalue=1.84e-55; confidence=high
Rice	`Os08g0139000` (OJ1119_D01.17-1) - identity=72; qcov=0.68; evalue=3.81e-51; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0080156 (mitochondrial mRNA modification)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790716.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057790716.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790716.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790716.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24936522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:24938505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr2:24938664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B106,B122,B139,B98
`Chr2:24938670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B139,B98
`Chr2:24938672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B122,B139,B98
`Chr2:24938673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B113,B135,C35
`Chr2:24938674`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A9,B113,B135,C35
`Chr2:24938674`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A9,B113,B135,C35
`Chr2:24938677`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A9,B113,B135,C35
`Chr2:24938677`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A9,B113,B135,C35
`Chr2:24938682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B129,B135,B91,C35
`Chr2:24938688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790716.1

147 aa

147

RRM_1

PF00076 RRM_1 54-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790716.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	54	120	2.3e-19	69.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934733.1
AAGCCCAATGTTATCATAAACCCATAGAGGCCACTTGCAAACTAGGGAAATCCAACTCTACTCGCCTCTTTCTGCCTCTCTAAAACCCCAACCCAGGAAAATAGCTTAAACCCAGAAATGGCGATGAGGGCTGCGGCGAGGGCGGCGGTTTCCGCCAATTCTCAATCTGGAATGCGAACAGGAATAAAGGCTGTTTGCTCTTCTTTTTCCAGCTTCCCGTTTAATCTACCACAGACCAAGACCGAGAAGCCTCCTCCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007816
ATGGCGATGAGGGCTGCGGCGAGGGCGGCGGTTTCCGCCAATTCTCAATCTGGAATGCGAACAGGAATAAAGGCTGTTTGCTCTTCTTTTTCCAGCTTCCCGTTTAATCTACCACAGACCAAGACCGAGAAGCCTCCTCCCGCTGAACCCTCTACCAATCTCTTCGTCTCGGGACTTAACAAACGCACAACAAGTGAAGGCCTTCGGGATGCTTTTGCTAAATTTGGTGAAGTTGTCCATGCTAAAGTGGTTACTGATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790716.1
MAMRAAARAAVSANSQSGMRTGIKAVCSSFSSFPFNLPQTKTEKPPPAEPSTNLFVSGLNKRTTSEGLRDAFAKFGEVVHAKVVTDRVSGFSKGFGFVKYATIEDAESGIKGMDGQFLDGWVIFAEYARPRAPFPPMNNNAPPQRQW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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