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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001349`

染色体: Chr02 坐标: 25214983-25218423 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001349`
名称	SmilChr02G001349
描述	uncharacterized SmilChr02G001349
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	25214983 - 25218423 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008183`
GeneID	`131008183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008183`
原始查询	`SmilChr02G001349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29.5; qcov=0.271; evalue=1.91e-34; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=32; qcov=0.598; evalue=8.99e-90; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791059.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791059.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791059.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791059.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791059.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:25214989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:25214991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:25214997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C54
`Chr2:25215000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B80
`Chr2:25215013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B130
`Chr2:25215028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,C34,C72,D9
`Chr2:25215059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C64,C66
`Chr2:25215062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A10,B133,B42,B43,B90,B92
`Chr2:25215069`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B103,B26,B51,B59,C12,C15,C39,C45
`Chr2:25215073`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B29,B37,C59
`Chr2:25215073`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B29,B37,C59
`Chr2:25215081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791059.1

1090 aa

545

1090

RVT_1

RVT_3

PF00078 RVT_1 267-528 aa PF13456 RVT_3 938-1058 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791059.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	267	528	1.6e-29	104.0	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057791059.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	938	1058	4.4e-17	62.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935076.1
ATGGGGAATAAATTTTTTAGATTTCTTGATATGTGGGCCCTTCACCCTGACTTCTTGCAGACTGTTGAAAGATCTTGGGTGATGGAGACGGATATTGTTTGTCCAATTTACAAAGTCATGGCGAAGCTTAAAAGGCTGAGGCATGAGCTCCGGAACTGGAACAAAAGCACCTTTGGTAATGTGGATACCATGCTCATGAACACGCAGCAGAAACTTTTAGATATTCAAATGCAGATCGCCTCTGATGGCTATACGGAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008183
ATGGGGAATAAATTTTTTAGATTTCTTGATATGTGGGCCCTTCACCCTGACTTCTTGCAGACTGTTGAAAGATCTTGGGTGATGGAGACGGATATTGTTTGTCCAATTTACAAAGTCATGGCGAAGCTTAAAAGGCTGAGGCATGAGCTCCGGAACTGGAACAAAAGCACCTTTGGTAATGTGGATACCATGCTCATGAACACGCAGCAGAAACTTTTAGATATTCAAATGCAGATCGCCTCTGATGGCTATACGGAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791059.1
MGNKFFRFLDMWALHPDFLQTVERSWVMETDIVCPIYKVMAKLKRLRHELRNWNKSTFGNVDTMLMNTQQKLLDIQMQIASDGYTEYLFDKELAAQAKINTALCRKNSLLQQKSRISWLKDGDRNTNFFHAMLKYRKKPHIISHLEVNGEQVFDQTQIGNHIVNFFSTLFTADNQGLEDIVAVEAVIDTFVSDLQNNLLVRLPDEEEITAAVFTMDSYSSPGPDGFSGKFCQSCWQIIKSDIWEAVQAFFRHSYLPQGCN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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